| 口蹄疫病毒O型泛亚株VP1蛋白的二级结构及抗原表位预测 |
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| 引用本文： | 李阳,马园,王国华,田普厚,李成龙,刘冬冬,张七斤.口蹄疫病毒O型泛亚株VP1蛋白的二级结构及抗原表位预测[J].中国动物检疫,2021,38(11):101-109. |
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| 作者姓名： | 李阳 马园 王国华 田普厚 李成龙 刘冬冬 张七斤 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目（2017YFD0500903） |
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| 摘 要： | 为获得口蹄疫病毒（FMDV）O/PanAsia毒株VPl蛋白的抗原信息，从而为制备多肽疫苗提供理论依据，运用生物信息学软件，对O/PanAsia毒株的结构蛋白VP1理化性质、结构功能以及细胞表位进行分析，预测抗原表位以选择合适肽段。应用ProParam、TMHMM Server、ProScale和SignaIP 等在线工具，分析VP1蛋白氨基酸序列，运用计算机技术和分子生物学软件，分析预测VP1蛋白的基本理化性质、结构功能以及可能的B细胞和T细胞抗原表位，筛选B细胞表位肽段并对VP1的两个主要T细胞表位CTL和Th细胞表位进行预测。结果显示：O/PanAsia毒株VP1 蛋白的等电点为9.49，相对分子质量为23 520.83；VP1蛋白的B细胞表位为8~23、135~149和193~205位氨基酸。预测该VP1有10个CTL和10个Th细胞抗原表位，表明其具有较好的免疫原性；最终筛选出VP1蛋白的5个CTL和5个Th优势表位。用生物信息学方法预测O/PanAsia毒株VPl蛋白为稳定性蛋白，含有T、B淋巴细胞抗原表位。本研究为FMDV的进一步研究和疫苗制备奠定了基础。
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| 关 键 词： | 口蹄疫病毒 VP1蛋白 理化性质 抗原表位 |
Prediction of the Secondary Structure and Epitopes of VP1 Protein of FMDV-O PanAsia Strain |
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| Li Yang,Ma Yuan,Wang Guohu,Tian Puhou,Li Chenglong,Liu Dongdong,Zhang Qijin.Prediction of the Secondary Structure and Epitopes of VP1 Protein of FMDV-O PanAsia Strain[J].China Journal Of Animal Quarantine,2021,38(11):101-109. |
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| Authors: | Li Yang Ma Yuan Wang Guohu Tian Puhou Li Chenglong Liu Dongdong Zhang Qijin |
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