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海蜇(Rhopilema esculentum)磷脂酶A2基因的cDNA、基因组克隆与表达分析
作者姓名:杨 洪  朱 玲  骆晓蕊  周春娅  庄志猛
作者单位:1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071;上海海洋大学水产与生命学院 上海201306;2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室 青岛 266071
基金项目:国家自然科学基金(31372507)、国家重点基础研究发展计划(973)项目(2011CB403605)和上海海洋大学研究生科研基金(A1-0209-14-0900-57)共同资助
摘    要:本研究利用RACE和RT-PCR技术克隆了海蜇(Rhopilema esculentum)磷脂酶A2基因(Re-PLA2-1)的cDNA及基因组序列,并分析了其mRNA在海蜇不同发育阶段的表达.Re-PLA2-1基因的cDNA全长为824 bp,包括了48 bp的5'非编码区、504 bp的开放阅读框及272 bp的3'非翻译区.SMART分析显示,Re-PLA2-1为分泌蛋白,包括了一个由19个氨基酸组成的信号肽和一个由118个氨基酸组成的磷脂酶A2结构域.多序列比对和系统进化分析显示,Re-PLA2-1基因与来自星状海葵(Nematostella vectensis)、僧袍芋螺(Conus magus)、长牡蛎(Crassostrea gigas)等磷脂酶A2的相似性较高,共同聚类为pfam09056 GIX PLA2分支,均包含pfam09056家族成员酶活性所必需的Ca2+结合位点、活性催化位点和PLA2结构域所必需形成二硫键的半胱氨酸.Re-PLA2-1基因组全长为2671 bp,由4个外显子和3个内含子组成.RT-PCR结果显示,Re-PLA2-1基因在海蜇4个发育阶段均有表达,其中,横裂体阶段的表达量最高,碟状体阶段最低.这些研究结果为进一步了解海蜇磷脂酶A2毒素的生物功能奠定了基础.

关 键 词:海蜇  磷脂酶A2  cDNA  基因组  表达分析
收稿时间:2015/5/21 0:00:00
修稿时间:2016/3/2 0:00:00

cDNA, Genome Cloning, and mRNA Expression of Phospholipase A2 Gene from the Rhopilema Esculentum
Authors:YANG Hong  ZHU Ling  LUO Xiaorui  ZHOU Chunya and ZHUANG Zhimeng
Institution:Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071; College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071;Marine Biology and Biotechnology Laboratory, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071; College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071;Marine Biology and Biotechnology Laboratory, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071 and Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071;Marine Biology and Biotechnology Laboratory, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071
Abstract:
Keywords:Rhopilema esculentum  Phospholipases A2  cDNA  Genome  Expression analysis
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