| 西洋参bHLH转录因子家族生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 闫艳,王希,周珂辉,李纪冬,韩鹏,邸鹏.西洋参bHLH转录因子家族生物信息学分析[J].吉林农业大学学报,2019,41(3):316-323. |
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| 作者姓名： | 闫艳 王希 周珂辉 李纪冬 韩鹏 邸鹏 |
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| 作者单位： | 吉林农业大学中药材学院,长春,130118;吉林农业大学,长春,130118 |
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| 基金项目： | 吉林省自然科学基金;国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | bHLH是真核生物中一类编码转录调控因子的基因家族,在植物生长发育中具有重要的调控作用。通过对西洋参根、叶、花蕾样品进行转录组测序,筛选其中的bHLH家族基因,利用生物信息学方法对筛选到的基因进行表达模式、蛋白结构、细胞定位及系统进化分析。结果显示:从西洋参转录组中共鉴定得到62个西洋参bHLH家族基因,这些bHLH在根、叶、花蕾中具有4种表达模式。西洋参bHLH亚细胞定位预测主要在细胞核内,所有表达产物均包含HLH结构域。进化分析显示,西洋参中62个bHLH基因可分为18个亚类,其中第Ⅺ亚族中包含最多的bHLH成员,共包含11个bHLH蛋白;第Ⅲf、Ⅳa、Ⅲ(a+c)、Ⅰb(2)、Orphans、Ⅳb亚族中的成员数量均为1个,其他亚族为2～9个。
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| 关 键 词： | 西洋参 bHLH基因家族 生物信息学方法 生物合成途径 |
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