| 大白猪及巴马香猪GHRH基因的SNPs筛选及其与体尺的相关性分析 |
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| 引用本文： | 李常红,孙安琪,刘号义,程云云.大白猪及巴马香猪GHRH基因的SNPs筛选及其与体尺的相关性分析[J].吉林农业大学学报,2019,41(3):348-353. |
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| 作者姓名： | 李常红 孙安琪 刘号义 程云云 |
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| 作者单位： | 白城师范学院生命科学学院,白城,137000;华南农业大学动物科学学院,广州,510642 |
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| 基金项目： | 博士科研启动基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金;吉林省科技发展计划;吉林省教育厅项目 |
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| 摘 要： | 为了解影响猪生长和体尺的重要候选基因(GHRH基因)多态性与猪体尺的相关性,选取大白猪为大型猪的代表,巴马香猪为小型猪的代表,利用测序法筛查了两猪种间GHRH基因上存在的SNPs,统计了各个SNP在2个猪种的基因型频率及等位基因频率,然后基于基因型频率对每个SNP与猪体型的相关性进行分析,并将筛选到的与猪体型相关的SNPs进行连锁不平衡及单倍型分析。结果表明:共有7个SNPs存在于两猪种间,分别为g.1874AC、g.2276AG、g.4165 C-、g.4238TC、g.8079 I-(GTGCTGGCGTGAG缺失)、g.8114AG及g.8178AG,且这些SNPs均与猪体尺性状显著相关,其中g.2276AG和g.4165 C-存在连锁效应,并且大白猪形成的优势单倍型为AC,而巴马香猪为G-型,单倍型频率在两猪种间存在极显著差异(P0. 001);位于基因内含子4的3个位点(g.8079 I-、g.8114 AG及g.8178AG)在大白猪中形成的单倍型为-GA,而巴马香猪为IAG,单倍型频率在两猪种间存在极显著差异(P0. 001)。这说明猪GHRH基因上存在的SNPs与猪体尺相关,可作为猪种遗传性状及育种的筛选标记,将为提高养猪经济效益及猪育种提供理论依据。
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| 关 键 词： | GHRH基因 猪 体尺 单核苷酸多态性 连锁不平衡 |
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