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| 适用于玉米DNA指纹库构建的SSR核心引物的重新设计与优化 | |
| 引用本文： | 于新艳,王风格,赵久然,王玺,易红梅,王璐,郭景伦,匡猛,孙艳美.适用于玉米DNA指纹库构建的SSR核心引物的重新设计与优化[J].分子植物育种,2007,5(3):443-447. |
| 作者姓名： | 于新艳 王风格 赵久然 王玺 易红梅 王璐 郭景伦 匡猛 孙艳美 |
| 作者单位： | 1. 沈阳农业大学农学院,沈阳,110161;北京市农林科学院玉米研究中心,北京,100097 2. 北京市农林科学院玉米研究中心,北京,100097 3. 沈阳农业大学农学院,沈阳,110161 |
| 基金项目： | 北京农业育种基础研究创新平台·北京市自然科学基金 |
| 摘 要： | 为了确定出适用于玉米DNA指纹库构建的引物,对部分并不是完全符合玉米DNA指纹库构建引物筛选原则的引物进行重新设计与优化,使其基本符合核心引物设计的要求.以umc2105、umc1705和phi299852为例,下载原引物的基因组序列,利用两个常用的引物设计软件Primer Premier 5.0和Oligo 6.57进行引物的重新设计及评估,在Tm值、GC含量、引发效率、错误引发率、3'端G值、引物二聚体等方面对引物进行改善,结果表明,经过对原引物的重新设计和优化,新设计的引物均能清晰的扩增,扩增效果得到了明显的改善,并且均能在统一的条件下进行实验,符合了玉米DNA指纹库构建的要求. |
| 关 键 词： | 玉米 SSR 核心引物 引物设计 |
Redesigning and Optimizing SSR Core Primer Pairs for Establishing DNA Fingerprinting Profiles |
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| Yu Xinyan,Wang Fengge,Zhao Jiuran,Wang Xi,Yi Hongmei,Wang Lu,Guo Jinglun,Kuang Meng,Sun Yanmei.Redesigning and Optimizing SSR Core Primer Pairs for Establishing DNA Fingerprinting Profiles[J].Molecular Plant Breeding,2007,5(3):443-447. | |
| Authors: | Yu Xinyan Wang Fengge Zhao Jiuran Wang Xi Yi Hongmei Wang Lu Guo Jinglun Kuang Meng Sun Yanmei |
| Abstract: | |
| Keywords: | Maize SSR Core primer Primer design |
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