| 2016年～2022年福建地区猪流行性腹泻病毒S基因的遗传变异分析 |
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| 引用本文： | 李雨琪,许静茹,郑欣,黄林洁,周娴静,朱智豪,陈芳婷,邓莹滋,蔡思思,靳雨欣,刘璐,董波,戴爱玲,李晓冰,范克伟.2016年～2022年福建地区猪流行性腹泻病毒S基因的遗传变异分析[J].中国预防兽医学报,2024(1):84-91. |
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| 作者姓名： | 李雨琪 许静茹 郑欣 黄林洁 周娴静 朱智豪 陈芳婷 邓莹滋 蔡思思 靳雨欣 刘璐 董波 戴爱玲 李晓冰 范克伟 |
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| 作者单位： | 1. 龙岩学院生命科学学院福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室动物源性人兽共患病防控福建省高校工程研究中心;2. 福建农林大学动物科学学院 |
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| 基金项目： | 福建省高校新世纪优秀人才支持计划项目(闽教科[2018] 47号)；;国家级大学生创新创业训练计划项目(202011312012、202111312006、202311312009)； |
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| 摘 要： | 为了解2016年～2022年福建地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行现状及遗传变异情况，本研究对从福建地区采集的231份疑似猪流行性腹泻(PED)发病仔猪病料样品经RT-PCR进行PEDV的检测，选取不同地区22份PEDV阳性样品经PCR扩增S基因并测序，采用MegAlign分析PEDV S基因及其编码氨基酸序列的相似性，采用MEGA7.0软件构建其系统发育树，采用MegAlign分析S基因编码氨基酸序列的分子特征，分别利用RDP4、SimPlot、MEGA7.0软件进行S基因的重组分析，并利用BEAST软件进行该基因分歧时间估算。结果显示，福建地区PEDV总阳性率为51.51%(119/231)，福建5个不同地区PEDV阳性率为40.00%～63.16%。从22份PEDV阳性样品中获得19条PEDV S基因序列，全长4149 bp～4161 bp，共编码1382 aa～1386 aa,19株PEDV S基因序列及其编码氨基酸序列之间相似性分别为94.4%～100%和93.8%～100%。19株PEDV S基因系统发育分析结果显示，其中18株PEDV属于GIIb亚型，1株属于GIb亚型...
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| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒 S基因 遗传变异 基因重组 分歧时间 |
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