基于血液转录组分析的长江江豚雌雄两性免疫适应性 |
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引用本文: | 尹登花,蔺丹清,严燕,郭弘艺,朱孝彦,张亚,刘凯,唐文乔.基于血液转录组分析的长江江豚雌雄两性免疫适应性[J].中国水产科学,2022,29(9):1247-1263. |
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作者姓名: | 尹登花 蔺丹清 严燕 郭弘艺 朱孝彦 张亚 刘凯 唐文乔 |
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作者单位: | 上海海洋大学, 海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室, 上海 201306 ;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心, 农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室, 江苏 无锡 214081;安庆市水产技术推广中心站, 安徽 安庆 246001 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目(2018YFD0900802); 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心基本科研业务费资助项目(2017JBFM10, 2018JBFM04); 农业农村部长江江豚调查和保护项目(17200360). |
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摘 要: | 为阐明长江江豚两性免疫系统特征及免疫适应性机制,本研究以 3 头雌性和 3 头雄性长江江豚(Neophocaena asiaeorientalis)血液为实验样本, 经 BGISEQ-500 测序平台进行 mRNA 和 microRNA 测序。结果显示, 从 6 个样本中共获得了 15878 个 unigenes 和 985 个 microRNAs, KEGG 分析发现有 1534 个 unigenes 注释到免疫系统相关类别并显著富集于 20 个常见免疫通路(P<0.05)。将两性血液转录组进行比较, 鉴定了 539 个差异表达基因(DEGs)和 160 个差异表达 miRNAs (DEMs), 其中有 299 个是雌偏好表达基因, 240 个是雄偏好表达基因。GO 和 KEGG 富集分析显示, 雌性长江江豚中血液基因与免疫反应和能量代谢功能显著相关, 而雄性长江江豚中血液基因与免疫反应和细胞生长功能显著相关。此外, 通路富集分析还发现 FoxO 和 Hippo 两条免疫相关信号通路在雌性长江江豚血液中被激活。基于 DEGs 和 DEMs 的联合分析, 预测了 45 对 miRNA-mRNA 负调控关系, 包括 13 个 DEMs 和对应靶向关系的 37 个免疫相关 DEGs。研究表明, microRNAs 通过调控基因表达参与长江江豚两性免疫系统, 且成年雌性长江江豚可能具有更强的免疫力及维持机体内稳态的能力。本研究旨在利用 RNA-seq 测序技术从基因表达调控水平解析长江江豚两性免疫适应性机制, 并为阐释雌雄长江江豚对多样生境的适应能力从免疫角度提供新视角, 同时为长江江豚保护提供科学借鉴。
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关 键 词: | 长江江豚 免疫适应性 性别 血液转录 |
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