| 美洲水貂DQA基因全长cDNA克隆及其生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 于振兴,孟冬梅,荣敏,姜莉莉,樊兆斌.美洲水貂DQA基因全长cDNA克隆及其生物信息学分析[J].吉林农业大学学报,2021,43(3):369-375. |
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| 作者姓名： | 于振兴 孟冬梅 荣敏 姜莉莉 樊兆斌 |
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| 作者单位： | 菏泽学院病原微生物及新型防治药物研发重点实验室,菏泽274015;中国农业科学院特产研究所/吉林省省部共建特种经济动物分子生物学国家重点实验室,长春130112 |
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| 摘 要： | 参考NCBIGenBank中上传的雪貂、海獭DQA基因序列设计出RT-PCR扩增引物,克隆了美洲水貂DQA基因全长cDNA序列;利用生物信息学软件构建了 DQA基因系统进化树,预测了 DQA蛋白结构与功能.结果表明:DQA基因全长cDNA序列大小为1 147 bp,ORF序列为768 bp,编码255个氨基酸,存在23个氨基酸的信号肽序列;DQA蛋白第236位氨基酸疏水性最强,53位氨基酸亲水性最强,218～240氨基酸可能为跨膜区域;蛋白质二级结构存在3个α-螺旋区和14个β-折叠区,处于无规则卷曲状态.获得了一个DQA蛋白三级结构模型,覆盖范围为25～208氨基酸;系统进化树表明,美洲水貂与欧洲雪貂亲缘关系最近,与家马关系最远.该研究结果为进一步阐明水貂DQA基因和蛋白的结构与功能提供了一定数据基础.
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| 关 键 词： | 水貂 DQA基因 克隆 生物信息学 |
Cloning and Bioinformatics of Full-length cDNA of DQA Gene in Neo-vison vison |
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| YU Zhenxing,MENG Dongmei,RONG Min,JIANG Lili,FAN Zhaobin.Cloning and Bioinformatics of Full-length cDNA of DQA Gene in Neo-vison vison[J].Journal of Jilin Agricultural University,2021,43(3):369-375. |
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| Authors: | YU Zhenxing MENG Dongmei RONG Min JIANG Lili FAN Zhaobin |
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