| 几个地方鸡种MHCB-G座位克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 屠云洁,苏一军,张学余,李国辉.几个地方鸡种MHCB-G座位克隆与生物信息学分析[J].中国畜牧杂志,2012,48(15):8-11. |
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| 作者姓名： | 屠云洁 苏一军 张学余 李国辉 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院家禽研究所,江苏扬州,225003 |
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| 基金项目： | 江苏省自然科学基金，国家863子课题，现代农业产业技术体系建设专项资金，江苏省农业科技支撑项目 |
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| 摘 要： | 本研究利用PCR和克隆测序方法,克隆新狼山鸡和仙居鸡MHC B-G基因全序列,分析序列的多态性并预测其蛋白质的结构与功能,为更好地保护地方鸡种提供基础资料。结果表明:分别获得新狼山鸡和仙居鸡MHCB-G基因6 183 bp和6 415 bp全序列,与红色原鸡同源性达98%,3鸡种存在148个变异位点,为3个单倍型,单倍型多样度为0.07407,仙居鸡在4413-4661位置缺失249 bp;利用生物信息学预测新狼山鸡和仙居鸡MHCB-G蛋白,该蛋白具有丰富的B细胞抗原位点;新狼山鸡和仙居鸡有明显的跨膜螺旋结构,分别含有138个和98个磷酸化位点;MHC B-G基因具有丰富的遗传多样性,该MHC B-G蛋白可能是抗原位点的富集区,对其进化、抗原递呈作用以及疾病和生产性能的相关性发生重要影响。
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| 关 键 词： | MHC 克隆 生物信息学 鸡 |
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