| 犬瘟热病毒H基因的序列分析 |
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| 引用本文： | 李丹丹,戚伟强,李传峰,等.犬瘟热病毒H基因的序列分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2017,45(2):31-36. |
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| 作者姓名： | 李丹丹 戚伟强 李传峰 等 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学 动物医学院；中国农业科学院 上海兽医研究所,中国农业科学院 上海兽医研究所,中国农业科学院 上海兽医研究所 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31270194)；上海市科委创新项目(13391901600) |
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| 摘 要： | 【目的】探索犬瘟热病毒(Canine distemper virus,CDV)基因的遗传变异情况,为CDV的防控提供理论依据。【方法】收集2014-2015年流行于上海和安徽两地的CDV野毒株,用RT-PCR方法克隆其血球凝集素蛋白基因(H),从分子水平上讨论CDV H基因的流行规律、遗传进化特性和变异情况。【结果】分离的5株CDV之间H基因核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为97.5%~99.9%和97.5%~99.2%,其与CDV疫苗株CDV3和Onderstepoort H基因核苷酸的同源性为90.9%~99.9%,氨基酸的同源性为90.4%~99.6%。进化树分析结果表明,分离到的5株CDV野毒株均属于亚洲Ⅰ型,与大部分的亚洲Ⅰ型处于同一分支。CDV H基因有9处潜在的天冬氨酸糖基化位点;H基因整体的同义突变概率与非同义突变概率的比例,即ds/dn=5.887 0。【结论】选择压力并未作用于分离到的CDV毒株,而是在中性选择作用下进化的。
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| 关 键 词： | 犬瘟热 H基因同源性 进化方式 天冬酰胺糖基化位点 |
| 收稿时间： | 2015/10/8 0:00:00 |
Genetic analysis of H gene of canine distemper virus |
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| LI Dandan,QI Weiqiang and LI Chuanfeng,et al.Genetic analysis of H gene of canine distemper virus[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2017,45(2):31-36. |
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| Authors: | LI Dandan QI Weiqiang and LI Chuanfeng |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | canine distemper disease similarities of H gene evolution pattern N-glycosylation sites |
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