黑龙江省籽用南瓜蔓枯菌潜在致病基因挖掘 |
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引用本文: | 赵茜.黑龙江省籽用南瓜蔓枯菌潜在致病基因挖掘[J].黑龙江农业科学,2023(6):38-44. |
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作者姓名: | 赵茜 |
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作者单位: | 黑龙江省农业科学院耕作栽培研究所 |
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摘 要: | 为了了解籽用南瓜蔓枯病的致病机制,前期鉴定出黑龙江省籽用南瓜蔓枯病的主要病原为Stagonosporopsis cucurbitacearum(Sc.)。在此基础上完成了Sc.1(生长在南瓜叶片上的Sc.菌株)和Sc.2(生长在PDA培养基上的Sc.菌株)组间样品的转录组差异表达分析。共获得319个差异表达基因,其中190个基因下调,129个基因上调;根据GO功能分析,挖掘到58个差异表达基因(DEGs)可能与致病相关;KEGG分析结果显示,挖掘与致病相关的KEGG通路有7个;挖掘到54个编码分泌蛋白基因是差异表达的;与PHI数据库进行比对,共识别到了2 869个基因有较高同源性,其中有96个是差异表达基因;在代谢过程的功能通路中共发现3 327个Sc.基因,结合转录组数据发现86个代谢相关基因差异表达。上述结果表明,真菌寄生在南瓜叶片上的代谢或生物合成途径相关基因的表达量与寄生在PDA培养基上的基因表达量存在着显著差异,这或许是影响Sc.致病性的重要因素。
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关 键 词: | 黑龙江省 籽用南瓜 蔓枯病 致病基因 |
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