| 苹果砧木‘SH6’叶绿体基因组序列特征和比较分析 |
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| 引用本文： | 邓玉林,王森,郑轶,姚允聪.苹果砧木‘SH6’叶绿体基因组序列特征和比较分析[J].北京农学院学报,2023(3):23-27+33. |
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| 作者姓名： | 邓玉林 王森 郑轶 姚允聪 |
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| 作者单位： | 北京农学院植物科学技术学院 |
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| 基金项目： | 北京市教委科研计划一般项目(KM202310020010)； |
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| 摘 要： | 【目的】为了解析苹果矮化中间砧‘SH6’叶绿体基因组特征及其进化关系。【方法】以苹果矮化中间砧‘SH6’为试材，通过HIFI测序，利用Organelle＿PBA软件进行叶绿体基因组从头组装，分析其叶绿体基因组特征。【结果】结果表明，‘SH6’叶绿体基因组大小为160 069 bp,具有典型的四分结构，包括大单拷贝区域、小单拷贝区域和两个反向重复区域，长度分别为88 184 bp、19 181 bp、26 352 bp和26 352 bp。在‘SH6’叶绿体基因组中，分别注释了蛋白质编码基因、tRNA和rRNA,其数量分别为86、36和8。此外，整合已发表的‘国光’、河南海棠、2个野生苹果和桃(Prunus persica)的叶绿体基因组数据来构建系统发育树，发现苹果中间砧‘SH6’与欧洲森林苹果聚在一枝上。【结论】推测苹果矮化中间砧品种‘SH6’与欧洲森林苹果关系较为密切。
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| 关 键 词： | 苹果砧木‘SH6’ 叶绿体基因组 序列特征分析 |
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