高粱的玉米黄质环氧化酶基因SbZEP表达与DNA变异分析 |
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引用本文: | 柴文婷,李华天,赵珊珊,杨博慧,刘卓君,王新宇,郝昱宁,史小霞,郭子浩,吕晋慧,张春来.高粱的玉米黄质环氧化酶基因SbZEP表达与DNA变异分析[J].山西农业科学,2023(10):1136-1143. |
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作者姓名: | 柴文婷 李华天 赵珊珊 杨博慧 刘卓君 王新宇 郝昱宁 史小霞 郭子浩 吕晋慧 张春来 |
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作者单位: | 1. 山西农业大学农学院;2. 山西农业大学林学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31971994); |
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摘 要: | 类胡萝卜素是维生素A的前体,是决定高粱籽粒营养品质的关键因素。为改良高粱籽粒营养品质,研究利用生物信息学和分子生物学试验方法对参试高粱类胡萝卜素中叶黄素循环的玉米黄质环氧化酶基因进行表达与DNA变异分析。结果表明,SbZEP为亲水性蛋白,亚细胞定位于内质网和叶绿体上;二级结构则以α-螺旋和无规则卷曲为主,SbZEP蛋白三级结构与预测一致,可信度高达90%;系统进化树分析表明,ZEP蛋白划分为6组,高粱与谷子的ZEP基因同源关系更近,同时在演化上有双子叶与单子叶的演化分隔。顺式作用元件分析表明,SbZEP含有光响应以及防御和应激响应元件,可能参与光反应和防御反应过程。高粱叶片发育过程中SbZEP基因的表达量明显增加;SbZEP在高粱种子、胚珠和茎表达水平较高;DNA重测序数据分析表明,SbZEP存在非同义突变,在不同品系对应不同位点的突变,可能与类胡萝卜素的合成与降解相关。
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关 键 词: | 高粱 ZEP 基因表达 生物信息学分析 DNA变异 |
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