| 糜子PmNAC1的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 辛旭霞,郑香然,王海岗,陈凌,Santra Dipak K,王瑞云,乔治军.糜子PmNAC1的克隆及生物信息学分析[J].山西农业科学,2023(10):1162-1169. |
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| 作者姓名： | 辛旭霞 郑香然 王海岗 陈凌 Santra Dipak K 王瑞云 乔治军 |
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| 作者单位： | 1. 山西农业大学农学院;2. 山西农业大学农业基因资源研究中心/农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室/杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室;3. 内布拉斯加大学林肯分校农艺系小宗粮豆研究与推广中心 |
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| 基金项目： | 国家现代农业产业技术体系建设专项（CARS-06-14.5-A16）；;山西省重点研发项目（2022ZDYF110）； |
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| 摘 要： | 糜子为禾本科草本植物，抗旱、耐盐碱、耐瘠、生育期短。为了给糜子抗逆分子育种提供候选基因，试验在前期转录组测序注释基因的基础上，利用糜子基因组染色体16上注释的NAC蛋白结构域比对得到PmNAC1基因的gDNA序列，通过PCR扩增、基因克隆获得糜子的核苷酸序列，使用在线软件ORF Finder Blast对糜子NAC编码蛋白的理化特性及结构等进行生物信息学分析。结果表明，PmNAC1基因全长1 634 bp，编码423个氨基酸，无信号肽和跨膜结构；二级结构中氨基酸主要由8个α-螺旋和14个β-折叠组成，为亲水性蛋白，保守位点在第73～211位氨基酸，共有59个磷酸化位点；超出水平线0.5的是糖基化位点；构建了糜子转录因子NAC氨基酸序列系统发育进化树，PmNAC1蛋白与柳枝稷CUC2的亲缘关系最近，二者的遗传变异系数为0.06。
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| 关 键 词： | 糜子 PmNAC1 克隆 生物信息学分析 |
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