| 不同品种绵羊肌内脂肪沉积相关miRNA的筛选与功能预测 |
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| 引用本文： | 孟科,赵薇,郭晨浩,聂伟,陶毛孩,袁晓春,孙昊然,冯登侦.不同品种绵羊肌内脂肪沉积相关miRNA的筛选与功能预测[J].江苏农业学报,2023(7):1554-1566. |
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| 作者姓名： | 孟科 赵薇 郭晨浩 聂伟 陶毛孩 袁晓春 孙昊然 冯登侦 |
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| 作者单位： | 1. 宁夏大学农学院;2. 宁夏中卫市沙坡头区畜牧水产技术推广服务中心 |
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| 基金项目： | 宁夏回族自治区自然科学基金项目(2020AAC03082)； |
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| 摘 要： | 为明确不同品种绵羊(Ovis aries)肌肉组织miRNA的表达情况，筛选影响绵羊肌内脂肪沉积的关键miRNA,以滩羊、杜泊羊和小尾寒羊为研究对象，测定背最长肌肌内脂肪含量并对其进行转录组测序(RNA-Seq),筛选绵羊脂肪沉积相关的差异表达miRNA。结果表明，滩羊肌内脂肪含量显著高于杜泊羊，极显著高于小尾寒羊；杜泊羊肌内脂肪含量显著高于小尾寒羊。转录组测序质量良好。3个品种绵羊共鉴定到134个已知miRNA和153个预测miRNA,这些miRNA的长度主要介于21～23 nt,且首位碱基对U碱基具有明显偏好性。以P≤0.05和|log2FC|>1(FC为差异倍数)为筛选条件，3个比较组共获得42个差异表达miRNA;杜泊羊与滩羊比较组中筛选出22个差异表达miRNA;小尾寒羊与杜泊羊比较组中筛选出21个差异表达miRNA;小尾寒羊与滩羊比较组中筛选出12个差异表达miRNA。筛选出的42个miRNA靶向到326个靶基因，显著富集到减数分裂I、肌肽-寡糖1,2-α-甘露糖苷酶活性和甘露寡糖甘露糖苷酶活性等303个基因本体(GO)条目，以及富集到α-亚麻酸...
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| 关 键 词： | 绵羊 肌内脂肪沉积 转录组 miRNA |
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