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甘薯Iborf56基因的克隆与表达分析
引用本文:常璐,董海涛,吕运韬,赵彩良,唐锐敏,贾小云.甘薯Iborf56基因的克隆与表达分析[J].山西农业科学,2023(6):610-619.
作者姓名:常璐  董海涛  吕运韬  赵彩良  唐锐敏  贾小云
作者单位:山西农业大学生命科学学院
基金项目:山西农业大学科技创新项目(2018yz001,2018YJ28);
摘    要:为了研究甘薯叶绿体基因Iborf56的表达是否受到盐胁迫的诱导以及对生长发育的影响,为甘薯的品种选育提供参考,以栗子香为研究材料,从中克隆Iborf56基因,通过生物信息学方法分析其蛋白序列特征,亚细胞定位预测、系统发育分析、调控元件分析、不同组织及盐胁迫表达模式,以及qPCR验证该基因的表达量。结果表明,Iborf56与已知序列相似度为99.28%,开放阅读框长度为929 bp,编码60个氨基酸,含有8个磷酸化位点,没有信号肽和跨膜区,不具有分泌蛋白的特性,主要由α-螺旋组成;亚细胞定位在叶绿体基质中;进化树分析表明,Iborf56与三浅裂野牵牛(Ipomoea trifida)和三裂叶薯(Ipomoea triloba)的遗传距离最近;启动子元件分析发现,该基因启动子区域含有光响应元件、抗逆和激素应答等功能元件。转录组以及实时荧光qRT-PCR定量分析表明,Iborf56在甘薯叶片中的表达量最高且随生长时间增加呈显著上升趋势,推测该基因参与甘薯的生长发育;此外,Iborf56基因的表达量随盐胁迫时间表现为先升后降的趋势,且该基因在盐胁迫下12 h时达到了临界值,暗示其可能参与甘薯盐...

关 键 词:甘薯  Iborf56基因  基因克隆  生物信息学分析  表达模式分析
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