| 谷子WAK基因家族全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 王雪,孙玉荣,张诺,李忠祥,任志贤,张宝俊.谷子WAK基因家族全基因组鉴定及表达分析[J].山西农业科学,2023(10):1153-1161. |
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| 作者姓名： | 王雪 孙玉荣 张诺 李忠祥 任志贤 张宝俊 |
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| 作者单位： | 山西农业大学植物保护学院 |
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| 基金项目： | 山西省重点研发计划项目（2022ZDYF117）； |
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| 摘 要： | 细胞壁关联蛋白激酶（Wall-associated kinases,WAKs）是一类独特的类受体蛋白激酶（Receptor like ki?nases,RLKs），在寄主植物抗病反应中起着关键作用。为分析谷子WAK基因家族的特征及潜在功能，基于已研究发表的拟南芥、水稻WAK蛋白序列，通过同源序列比对的方法对xiaomi全基因组进行WAK基因家族鉴定，借助TBtools、MEGA等软件对谷子WAK基因理化性质、基因定位、系统进化、保守结构域、顺式作用元件进行分析。结果表明，共鉴定到谷子WAK家族成员41个，在谷子1～9号染色体上均有分布，编码590～1 131个氨基酸；蛋白质分子质量为65.62～123.36 ku，等电点为5.18～8.49;Si3g36660、Si7g23280、Si8g19780的蛋白表现为疏水性，其他蛋白均为亲水性；亚细胞定位预测结果显示，28个基因定位于质膜，6个基因定位于叶绿体，其他基因分别定位于高尔基体、液泡、内质网、细胞外基质。系统发育分析结果显示，谷子、拟南芥和水稻的WAK基因家族可分为5类，其中，Si1g24650与Os01g26174、Si1g123...
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| 关 键 词： | 谷子 WAK基因家族 系统进化 生物信息学分析 表达分析 |
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