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模式植物狗尾草响应不同干旱及盐胁迫表达的内参基因actin及其应用
引用本文:张丽丽,赵辉,郭静远,夏启玉,贺萍萍,霍姗姗,屈静,符冬妹,郭安平.模式植物狗尾草响应不同干旱及盐胁迫表达的内参基因actin及其应用[J].热带作物学报,2019,40(12):2418-2425.
作者姓名:张丽丽  赵辉  郭静远  夏启玉  贺萍萍  霍姗姗  屈静  符冬妹  郭安平
作者单位:中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室/海南省南繁生物安全与分子育种重点实验室,海南海口 571101
基金项目:海南省自然科学基金项目(No.318QN285);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项-中国热带农业科学院院级创新团队项目(No.1630052017012);转基因生物新品种培育国家科技重大专项“转基因作物南繁区生态环境监测与防控研究”(No.2016ZX08012005-007)
摘    要:为了研究应用于狗尾草响应不同干旱及盐胁迫基因表达的内参基因,本研究从网站https://phytozome.jgi.doe. gov/pz/portal.html上获得狗尾草A10品系8个actin基因的cDNA序列,设计荧光定量PCR引物,以不同程度的干旱及不同浓度盐胁迫处理的狗尾草幼苗cDNA做模板,进行荧光定量PCR试验,通过实时荧光定量PCR扩增片段电泳分析,扩增曲线及溶解曲线综合分析,结果表明登录号Sevir.9G114100对应的actin基因是8个actin基因中最合适的内标基因。并对所选内标的实用性进行了验证,验证的结果与转录组数据的结果保持一致,证明所选内标基因可用于后续狗尾草响应不同干旱及盐胁迫狗尾草转录组基因表达的验证工作,为深入研究狗尾草功能基因奠定分子基础。

关 键 词:狗尾草  actin基因  干旱胁迫  盐胁迫  荧光定量PCR  
收稿时间:2019-04-11

Internal Reference Gene Actin of Setaria viridis and Its Application in Response to Different Drought and Salt Stress
ZHANG Lili,ZHAO Hui,GUO Jingyuan,XIA Qiyu,HE Pingping,HUO Shanshan,QU Jing,FU Dongmei,GUO Anping.Internal Reference Gene Actin of Setaria viridis and Its Application in Response to Different Drought and Salt Stress[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2019,40(12):2418-2425.
Authors:ZHANG Lili  ZHAO Hui  GUO Jingyuan  XIA Qiyu  HE Pingping  HUO Shanshan  QU Jing  FU Dongmei  GUO Anping
Institution:Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences / Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Ministry of Agriculture and Rural Affairs / Hainan Key Laboratory for Biosafety Monitoring and Molecular Breeding in Off-Season Reproduction Regions, Haikou, Hainan 571101, China
Abstract:
Keywords:Setaria viridis  actin gene  drought stress  salt stress  RT-PCR  
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