| 基于转录组的剑麻ARF基因家族的鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 鹿志伟,侯晓婉,杨子平,张燕梅,李俊峰,周文钊.基于转录组的剑麻ARF基因家族的鉴定及表达分析[J].热带作物学报,2019,40(10):1972-1978. |
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| 作者姓名： | 鹿志伟 侯晓婉 杨子平 张燕梅 李俊峰 周文钊 |
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| 作者单位： | 1. 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,广东湛江 5240912. 湛江市热带作物遗传改良重点实验室,广东湛江 524091 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-16);中国热带农业科学院南亚热带作物研究所基本科研业务费专项(1630062019021);海南省自然科学基金青年基金项目“剑麻AsMYC2下游抗病关键基因筛选及鉴定”(319QN288) |
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| 摘 要： | 生长素反应因子（Auxin Response Factors, ARFs）是植物特有的多基因转录因子家族,参与植物生长发育过程的调节。本研究基于转录组数据,通过生物信息学方法鉴定剑麻ARF基因家族成员,同时对其进行相关生物信息学分析。结果表明：在剑麻中共鉴定得到15个ARF基因,并依次命名为AhARF 1~15。其编码的蛋白质含有409~1011个氨基酸,分子量约为45.17~112.13 ku,等电点为5.17~9.34。亚细胞定位预测结果显示,13个AhARFs定位于细胞核,2个AhARFs定位于叶绿体。保守结构域分析结果表明,AhARFs基因家族有8个成员同时含有B3、ARF和Aux/IAA这3个相对保守的结构域,其他成员仅含有B3和ARF这2个结构域。进化树分析表明,剑麻AhARFs蛋白可分为5个亚家族。15个剑麻AhARFs基因在剑麻紫色卷叶病不同发病时期呈现不同的表达规律。本研究为进一步深入探索剑麻ARF基因家族的功能奠定了重要理论基础。
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| 关 键 词： | 剑麻 ARF 基因家族 转录组 |
| 收稿时间： | 2019-04-01 |
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