| 香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 杨会晓,孙媛媛,贾彩红,金志强,徐碧玉,王卓.香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析[J].热带作物学报,2019,40(10):1949-1957. |
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| 作者姓名： | 杨会晓 孙媛媛 贾彩红 金志强 徐碧玉 王卓 |
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| 作者单位： | 1. 中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业农村部热带生物技术重点实验室,海南海口 5711012. 南京农业大学园艺学院,江苏南京 210095 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31501624);海南省自然科学基金资助项目(318MS090);现代农业产业技术体系(CARS-32) |
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| 摘 要： | 苯丙氨酸解氨酶（Phenylalanine ammonia-lyase, PAL）是催化苯丙烷代谢途径第1步反应的限速酶,广泛地参与植物生长发育过程中的各种生理活动。本研究通过生物信息学分析,从香蕉A基因组数据库中利用BLASTp筛选出53个可能的MaPAL编码蛋白序列。在NCBI分析蛋白保守结构域,发现仅有8个基因具有典型的PAL家族基因的特性。聚类分析结果表明香蕉MaPAL家族的8个基因可以分为Class I 和Class II两类。转录组数据表明,所有MaPAL基因在果实发育阶段高表达,MaPAL5参与果实采后成熟过程。在干旱、低温、盐处理的香蕉幼苗叶片中,MaPAL1、MaPAL2、MaPAL3、MaPAL4和MaPAL5成员均显著上调表达,MaPAL6号成员显著下调表达,这些成员参与香蕉响应上述非生物胁迫过程。8个MaPAL成员在枯萎病菌处理下均显著下调表达,表明在感病品种巴西蕉根系中,MaPAL基因的表达全部被Foc TR4抑制。本研究结果为分析MaPAL基因家族在香蕉果实品质形成和响应逆境中的作用提供了理论依据。
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| 关 键 词： | 香蕉 苯丙氨酸解氨酶 系统进化分析 表达分析 基因家族 |
| 收稿时间： | 2019-07-30 |
Identification and Expression Analysis of Phenylalanine Ammonia- lyase Gene Family in Banana |
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| YANG Huixiao,SUN Yuanyuan,JIA Caihong,JIN Zhiqiang,XU Biyu,WANG Zhuo.Identification and Expression Analysis of Phenylalanine Ammonia- lyase Gene Family in Banana[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2019,40(10):1949-1957. |
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| Authors: | YANG Huixiao SUN Yuanyuan JIA Caihong JIN Zhiqiang XU Biyu WANG Zhuo |
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| Institution: | 1. Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences / Key Laboratory of Tropical Biotechnology, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Haikou, Hainan 571101, China2. College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, Jiangsu 210095, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | banana phenylalanine ammonia-lyase phylogenetic analysis expression analysis gene family |
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