内蒙古白绒山羊编码HGT-Ⅰ型蛋白的特征分析 |
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引用本文: | 赵冰,李玉荣,尹俊,李金泉,梁涛.内蒙古白绒山羊编码HGT-Ⅰ型蛋白的特征分析[J].畜牧与饲料科学,2004(4). |
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作者姓名: | 赵冰 李玉荣 尹俊 李金泉 梁涛 |
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作者单位: | 内蒙古农业大学动物科学与医学学院 内蒙古呼和浩特010018
(赵冰,李金泉),内蒙古畜牧科学院 内蒙古呼和浩特010030
(李玉荣),内蒙古农业大学生物工程学院 内蒙古呼和浩特010018
(尹俊),内蒙古鄂尔多斯市杭锦旗家畜改良工作站 内蒙古杭锦旗017400(梁涛) |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(39969002)。 |
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摘 要: | 对内蒙古白绒山羊毛囊兴盛期的表达序列标签(EST)进行生物信息学方法的分析,通过在Genbank核酸数据库的Blastn相似性检索后发现有22个ESTs与小鼠的HGTproteintypeIE5mRNA基因有很高的同源性,进一步地分析发现这22个ESTs可分为两种不同的序列。经ORF(开放读码框)的预测共编码2种不同的蛋白质。这2个蛋白质的氨基端和羧基端的氨基酸残基都十分得相似,其甘氨酸、酪氨酸的含量达到了71.93%,而苯丙氨酸的含量达到了10.18%。并对其进行了二级结构的预测,发现它们在二级结构上有着很高的相似性。这2个蛋白质家族成员与小鼠的HGT蛋白质在氨基酸的组成和结构上都有很高的保守性。
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关 键 词: | 绒山羊 表达序列标签 角蛋白关联蛋白 |
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