| 赣南柑橘产区衰退病毒外壳蛋白基因初步分析 |
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| 引用本文： | 刘志芳,易龙,卢占军,高玉霞.赣南柑橘产区衰退病毒外壳蛋白基因初步分析[J].广西农业科学,2015,46(1). |
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| 作者姓名： | 刘志芳 易龙 卢占军 高玉霞 |
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| 作者单位： | 国家脐橙工程技术研究中心,江西 赣州 341000;赣南师范学院 生命与环境科学学院,江西 赣州 341000 |
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| 基金项目： | 教育部科学技术研究重点项目，江西省自然科学基金项目，江西省青年科学家培养计划项目，江西省高等学校科技落地计划项目 |
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| 摘 要： | 目的]对江西赣南柑橘果园感染衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)样品的外壳蛋白(CP)基因进行克隆及序列遗传信息分析,为利用弱毒株交叉保护法预防该地区CTV的蔓延奠定基础.方法]运用RT-PCR扩增样品的CP基因并测序,应用软件检测CP序列基因重组,分析碱基含量,再将所测序列与10个外国CTV分离株计算核苷酸遗传距离,比对序列同源性及构建系统发育树.结果]214份柑橘样品中有78份感染了CTV,发病率为36.4％.78个样品中仅有一个存在基因重组现象;78个CTV分离株CP基因全长序列均为672 bp,无碱基缺失、插入等现象,CP基因平均GC含量为52.8％,AT(U)为47.2％;所有样品核苷酸遗传距离在0～0.072,与10个已知CTV分离株CP基因核苷酸遗传距离在0～0.106.78个样品的CP基因核苷酸及其推导氨基酸序列同源性分别为89.1％～100.0％和92.3％～100.0％,与10株已知CTV分离株的同源性分别为76.5％～98.9％和73.6％～99.5％.系统进化分析结果表明,78个分离样品与10株已知CTV分离株可聚为四大类群,第Ⅰ类群包含49个分离样品和7个症状不同的已知CTV分离株(6个强毒型和1个弱毒型);第Ⅱ类群包含21个样品,国外强毒株系Qaha和引发茎陷点、速衰症状的Mexico-ctv株系聚于此类群;第Ⅲ类群仅由采自瑞金的CRJ14组成;第Ⅳ类群包括一个国外强毒株系HA16-5和采自江口、宁都的样品.结论]赣南柑橘产区CTV分离株的CP基因保守性较高,序列存在一定程度的变异;各分离株间亲缘性较高但关系复杂,大部分样品与强毒型和茎陷点型分离株相关.
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| 关 键 词： | 柑橘衰退病毒 外壳蛋白基因 序列分析 基因重组 |
Preliminary analysis on coat protein gene of Citrus tristeza virus collected from citrus production regions in South Jiangxi province |
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| LIU Zhi-fang,YI Long,LU Zhan-jun,GAO Yu-xia.Preliminary analysis on coat protein gene of Citrus tristeza virus collected from citrus production regions in South Jiangxi province[J].Guangxi Agricultural Sciences,2015,46(1). |
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| Authors: | LIU Zhi-fang YI Long LU Zhan-jun GAO Yu-xia |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Citrus tristeza virus coat protein gene sequence analysis gene recombination |
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