| 油菜miR156基因家族及其靶基因生物信息学分析及鉴定 |
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| 引用本文： | 李晓康,刘红芳,刘婧琳,郑明,华玮.油菜miR156基因家族及其靶基因生物信息学分析及鉴定[J].中国油料作物学报,2018,40(2):162. |
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| 作者姓名： | 李晓康 刘红芳 刘婧琳 郑明 华玮 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院油料作物研究所，农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室，湖北 武汉，430062 |
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| 基金项目： | 湖北省自然科学基金（2016CFB286）；国家863计划（2013AA102602） |
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| 摘 要： | 为阐明油菜miR156基因家族的进化过程和靶基因作用位点，分析了油菜miR156基因家族的序列特征、进化模式和候选靶基因。共获得35个bna-miR156基因，对应44个成熟序列。这些bna-miR156基因分布在油菜的17条染色体上，其中C3染色体上分布着5个bna-miR156基因。bna-miR156基因在产生成熟序列的区域高度保守，而其它其它位置保守性较低，进化分析结果显示bna-miR156家族可以分为5个分支，家族成员分布较为分散，且位于同一条染色体上的bna-miR156基因并没有表现出更近的亲缘关系。另外，系统发育分析结果显示SBP-box基因在双子叶植物油菜、拟南芥中存在相似的进化模式，进一步发现只有部分BnaSBP家族基因拥有bna-miR156的作用位点，其中30个BnaSBP基因的靶位点位于编码区，11个位于3`UTR。一些拥有bna-miR156作用位点的BnaSBP具有组织表达特异性，因此bna-miR156可能与BnaSBP相互作用，调控油菜生长发育过程。
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| 关 键 词： | 油菜 miR156 序列分析 分子进化 靶位点 |
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