| 芥菜型油菜TT1基因的克隆和SNP分析 |
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| 引用本文： | 严明理,刘显军,官春云,刘丽莉,陆赢,刘忠松.芥菜型油菜TT1基因的克隆和SNP分析[J].作物学报,2010,3(10):1634-1641. |
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| 作者姓名： | 严明理 刘显军 官春云 刘丽莉 陆赢 刘忠松 |
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| 作者单位： | 1湖南科技大学生命科学学院，湖南湘潭410201；2湖南农业大学油料作物研究所，湖南长沙410128 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(30471098).湖南省自然科学基金项目，湖南省教育厅青年基金项目，作物种质创新与资源利用国家重点实验室培育基地开放基金项目 |
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| 摘 要： | 拟南芥的TT1基因(编码含有WIP结构域的锌指蛋白)对种皮的发育和颜色的形成具有重要的调控作用。本研究利用同源克隆和RACE技术分离了芥菜型油菜TT1基因,在芥菜型油菜黄黑籽材料的种皮中进行转录水平的分析,比较了黑籽油菜与黄籽油菜基因序列的差异,并采用等位基因特异(allele-specific)PCR技术对可能存在的单核苷酸多态位点进行验证。结果表明,芥菜型油菜TT1基因的DNA序列全长为2197bp,包含1个内含子,与甘蓝型油菜TT1-1基因的DNA序列的相似性为99%,与拟南芥的TT1基因DNA序列的相似性为85%;推导的TT1蛋白序列为300氨基酸残基,理论分子量为33.97kD,等电点为6.99;TT1在所有材料的种皮中均检测到表达;比较紫叶芥、四川黄籽、NILA和NILB的TT1基因序列,共发现8个核苷酸变异位点,均在基因的外显子区域,其中紫叶芥和NILA的序列相同,四川黄籽和黒籽近等基因系NILB的序列相同。与紫叶芥相比,黒籽近等基因系NILB有8个核苷酸差异,但种皮颜色与紫叶芥一样,均为黑色,TT1基因这些位点的突变并不影响芥菜型油菜种皮的颜色。通过等位特异PCR可以区分来自四川黄籽与紫叶芥的TT1基因。
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| 关 键 词： | 芥菜型油菜 TT1基因 克隆 单核苷酸多态性 |
| 收稿时间： | 2010-04-05 |
Cloning and SNP Analysis of TT1 Gene in Brassica juncea |
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| YAN Ming-Li,LIU Xian-Jun,GUAN Chun-Yun,LIU Li-Li,LU Ying,Zhong-Song.Cloning and SNP Analysis of TT1 Gene in Brassica juncea[J].Acta Agronomica Sinica,2010,3(10):1634-1641. |
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| Authors: | YAN Ming-Li LIU Xian-Jun GUAN Chun-Yun LIU Li-Li LU Ying Zhong-Song |
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| Institution: | 1.School of Biology, Hunan University of Science and Technology, Xiangtan 411201, China;2.Oilseed Research Institute, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China |
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| Abstract: | The quality of rapeseed can be further improved through the development of yellow-seeded cultivars,which are known to contain less lignin and more proteins,both enhancing the dietary feed value.The TT1 gene encodes a WIP domain protein with Zn-finger,which is essential for seed coat development and organ color in Arabidopsis,its mutation causes transparent testa.In order to study molecular mechanism of seed coat color in rapeseed,TT1 gene was cloned from Brassica juncea using homology-based cloning and RACE... |
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| Keywords: | Brassica juncea TT1 Cloning Single nucleotide polymorphism |
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