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油茶WRKY基因家族鉴定及逆境胁迫表达分析
引用本文:苏文娟,曹瑞兰,周增亮,赵娜红,张运煜,胡冬南,刘娟.油茶WRKY基因家族鉴定及逆境胁迫表达分析[J].中南林业科技大学学报,2023(3):155-166+174.
作者姓名:苏文娟  曹瑞兰  周增亮  赵娜红  张运煜  胡冬南  刘娟
基金项目:国家重点研发计划项目(2018YFD1000603);;国家自然科学基金项目(31760223);
摘    要:【目的】WRKY转录因子在植物应对生物和非生物胁迫中起重要调控作用。油茶是我国南方丘陵地区重要的经济树种,常受各种逆境胁迫影响。深入挖掘油茶WRKY基因家族成员并探讨其应对逆境胁迫的表达调控模式具有重要意义。【方法】以油茶全基因组数据为参考,利用生物信息学方法,鉴定分析了CoWRKYs基因家族成员,并基于油茶逆境胁迫的相关转录组数据,明确CoWRKYs在低磷、干旱和低温等非生物胁迫下的表达模式,最后基于qRT-PCR方法解析CoWRKYs在不同逆境胁迫下的瞬时表达特征。【结果】CoWRKYs基因家族包含89个成员(CoWRKY1~CoWRKY89)。根据系统发育特征可将其分为3大类,I类、II类和III类的数量分别为20、55和14。保守基序分析表明,进化关系密切的CoWRKYs蛋白具有相同或相似的基序组成。CoWRKYs在低磷、干旱、低温等非生物胁迫下表达谱分析的结果显示,65个CoWRKYs呈现显著表达差异,其中17个CoWRKYs同时受三种非生物胁迫的调控,且大部分基因在逆境胁迫下表现为上调表达,推测这些CoWRKYs在油茶的非生物逆境胁迫中可能起正调控作用。qRT-PCR结果表...

关 键 词:油茶  WRKY基因家族  表达分析  逆境胁迫
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