| 利用生物信息学和qRT-PCR分析鉴定水稻细菌性条斑病QTL qBlsr5a的候选基因 |
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| 引用本文： | 谢小芳,林德塨,许国泉,李春兰,陈志伟,吴为人.利用生物信息学和qRT-PCR分析鉴定水稻细菌性条斑病QTL qBlsr5a的候选基因[J].分子植物育种,2013(3):293-298. |
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| 作者姓名： | 谢小芳 林德塨 许国泉 李春兰 陈志伟 吴为人 |
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| 作者单位： | 1. 福建农林大学生命科学学院，福州，350002
2. 福建农林大学作物科学学院，福州，350002 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，福建省自然科学基金项目，福建省创新训练项目 |
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| 摘 要： | 细菌性条斑病(简称细条病)是水稻的主要病害之一。前期研究已将细条病抗性QTL qBlsr5a精细定位在5号染色体上一个大约300kb的区间内。为了寻找该QTL的候选基因,本研究利用生物信息学方法对该区间进行分析,筛选出10个与抗病相关的注释基因。然后以感病品种H359及其抗病近等基因系H359-BLSR5A为材料,对细条病菌接种后这10个基因的表达动态进行qRT-PCR分析。结果表明,2个基因在抗、感材料中几乎没有检测到表达产物;7个基因对病原菌侵染没有明显的响应;1个基因(LOC_Os05g-01700)在病原菌侵染后表达量发生变化且在抗、感材料间存在显著差异。因此推测,该基因是qBlsr5a的一个重要的候选基因。
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| 关 键 词： | 细菌性条斑病 qBlsr5a 候选基因 生物信息学 qRT-PCR |
Identification of Candidate Genes for QTL qBlsr5a Conferring Resistance to Bacterial Leaf Streak in Rice by Bioinformatics and qRT-PCR Analyses |
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| Xie Xiaofang
,
Lin Degong
,
Xu Guoquan
,
Li Chunlan
,
Chen Zhiwei
,
Wu Weiren.Identification of Candidate Genes for QTL qBlsr5a Conferring Resistance to Bacterial Leaf Streak in Rice by Bioinformatics and qRT-PCR Analyses[J].Molecular Plant Breeding,2013(3):293-298. |
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| Authors: | Xie Xiaofang Lin Degong Xu Guoquan Li Chunlan Chen Zhiwei Wu Weiren |
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| Institution: | 1 College of Life Sciences, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, 350002; 2 College of Crop Sciences, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, 350002 |
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