| 暗纹东方鲀TGF-β1基因的克隆、表达特征及生长性状相关SNP位点筛选 |
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| 引用本文： | 马思思,喻伟峰,张凯,张雯雯,唐晓东,刘雨曦,尹绍武,王涛.暗纹东方鲀TGF-β1基因的克隆、表达特征及生长性状相关SNP位点筛选[J].海洋渔业,2024(2):129-139. |
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| 作者姓名： | 马思思 喻伟峰 张凯 张雯雯 唐晓东 刘雨曦 尹绍武 王涛 |
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| 作者单位： | 1. 南京师范大学海洋科学与工程学院;2. 江苏省特色水产育种与绿色高效养殖技术工程研究中心 |
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| 基金项目： | 江苏省农业科技自主创新项目[CX(22)2029]；;国家自然科学基金(32172948,31800436)；;国家重点研发计划(2018YFD0900301)；;江苏省自然科学基金青年基金(BK20210563)； |
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| 摘 要： | 为探究暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)TGF-β1基因与其生长性状的关联及作用，采用RACE技术克隆了暗纹东方鲀TGF-β1基因，分析了其基因结构与表达特征，并通过直接PCR扩增法对TGF-β1基因进行多片段比对，在此基础上筛选出与生长性状相关的SNP位点。研究发现TGF-β1基因cDNA全长共2 217 bp,包含5′UTR 51 bp, 3′UTR 1 014 bp, ORF 1 152 bp,编码383个氨基酸。氨基酸序列比对分析表明，暗纹东方鲀TGF-β1基因与红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)同源性最高(92.82%)。进化树分析表明，暗纹东方鲀TGF-β1基因编码氨基酸序列与红鳍东方鲀聚为一支，与鲈形目鱼类亲缘关系最近(68.46%～73.33%)。qRT-PCR检测显示，TGF-β1基因在暗纹东方鲀8种不同组织(心脏、肝脏、脑、脾脏、肾脏、肌肉、中肠和鳃)都有表达，其中肾脏表达量最高，心脏和脾脏表达量次之。通过SNP位点不同基因型与个体生长性状的相关性分析，发现TGF-β1上的SNP g. 3908 C>A位点与暗纹东方鲀多项生长性状...
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| 关 键 词： | 暗纹东方鲀 TGF-β1 表达特征 生长性状 SNP |
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