| 橄榄转录组SSR信息分析及分子标记开发与应用 |
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| 引用本文： | 谢倩,张诗艳,江来,丁明月,刘玲玲,吴如健,陈清西.橄榄转录组SSR信息分析及分子标记开发与应用[J].园艺学报,2023(11):2350-2364. |
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| 作者姓名： | 谢倩 张诗艳 江来 丁明月 刘玲玲 吴如健 陈清西 |
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| 作者单位： | 1. 福建农林大学园艺学院;2. 福建省农业科学院果树研究所 |
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| 基金项目： | 福建省现代农业产业技术体系建设专项（闽财教指[2021]61号）； |
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| 摘 要： | 选取不同品种（系）橄榄成熟果进行转录组测序，结果获得296 314条序列，应用MISA软件进行SSR位点分析，获得86084个SSR位点，分布在70686条序列中，SSR在所检测序列中出现频率为23.86%，其中54735条序列含有两个及以上的SSR位点，占比达68.4%；橄榄转录组中SSR序列以复合型核苷酸、单核苷酸、二核苷酸重复类型为主，三者占SSR总数的88.88%；单核苷酸、二核苷酸重复类型中优势基元分别为A/T、AG/CT/TC/GA。以6个不同橄榄品系（种）为研究对象，对随机挑选的99对SSR引物进行有效性与多态性筛选，最终开发了53个有效性SSR分子标记，12个多态性SSR分子标记。利用开发的12个多态性EST-SSR标记对59份橄榄种质进行多态性评价与群体结构分析，结果共检测到48个多态性位点，香农多样性指数平均0.876，多态信息含量平均0.426。利用混群模型分组、UPGMA聚类和PCA对59份橄榄种质进行群体结构分析，混群模型分析结果与UPGMA聚类结果、主成分分析结果有类群上的交叉，但类群数有所不同，混群模型将其划分为3个类群；UPGMA聚类分析在遗传相似系数为...
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| 关 键 词： | 橄榄 转录组 SSR 多态性引物 遗传多样性 群体结构 |
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