| 木本油料文冠果APETALA2基因全长cDNA序列与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘晓辉,马静怡,罗媛,李志民,王莉.木本油料文冠果APETALA2基因全长cDNA序列与生物信息学分析[J].现代农业科技,2018(2). |
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| 作者姓名： | 刘晓辉 马静怡 罗媛 李志民 王莉 |
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| 作者单位： | 大连民族大学环境与资源学院; |
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| 摘 要： | 文冠果是我国北方特有的木本油料树种。AP2是植物种子发育调控的重要转录因子。根据已获得的文冠果转录组数据搜索文冠果AP2基因序列(XsAP2),并对XsAP2基因全长cDNA序列进行生物信息学分析。结果表明,XsAP2基因cDNA序列包含1个长度为1 548 bp的完整ORF,编码515个氨基酸。XsAP2蛋白大部分区域为亲水区,由136个ɑ螺旋、89个延伸链、43个β-转角、247个无规则卷曲构成。依据2gcc.1.A同源建模法,获得1个三级结构模型,该模型从第153个氨基酸开始到第213个氨基酸结束。XsAP2蛋白与9种其他植物AP2蛋白的同源性分析显示,文冠果AP2与可可AP2的同源性最高(71%)。该结果可为解析文冠果种子生长发育的分子调控机制提供理论依据,并有助于文冠果油品质改良和文冠果分子育种工作。
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| 关 键 词： | 文冠果 APETALA2基因 cDNA 亲水性 ɑ螺旋 同源性 |
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