| 玉米β-甘露聚糖酶基因家族的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 高清松,孙辉,陈国冲,韦雨亭,黄雨晴,史胜男,胥明,周建.玉米β-甘露聚糖酶基因家族的生物信息学分析[J].安徽农业科学,2018,46(16). |
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| 作者姓名： | 高清松 孙辉 陈国冲 韦雨亭 黄雨晴 史胜男 胥明 周建 |
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| 作者单位： | 淮阴师范学院生命科学学院,江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心/江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏淮安223300;淮阴师范学院生命科学学院,江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心/江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏淮安223300;淮阴师范学院生命科学学院,江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心/江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏淮安223300;淮阴师范学院生命科学学院,江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心/江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏淮安223300;淮阴师范学院生命科学学院,江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心/江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏淮安223300;淮阴师范学院生命科学学院,江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心/江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏淮安223300;淮阴师范学院生命科学学院,江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心/江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏淮安223300;淮阴师范学院生命科学学院,江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心/江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏淮安223300 |
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| 基金项目： | 江苏省自然科学基金项目;江苏省大学生实践创新训练计划项目;江苏省高校自然科学研究面上项目;江苏高校品牌专业建设工程资助项目 |
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| 摘 要： | 目的]鉴定出玉米基因组中的β-甘露聚糖酶基因(MAN),并分析其进化机制和表达模式。方法]利用拟南芥MAN蛋白序列在玉米基因组数据库以及NCBI非冗余蛋白质数据库中比对搜索,获取玉米MAN家族全部成员;通过检索植物基因组复制数据库查找玉米MAN基因的片段复制事件;利用GSDS 2.0服务器分析基因外显子/内含子结构;采用MEGA7软件极大似然法构建系统发育树;利用芯片数据分析基因在不同组织器官中的表达模式。结果]玉米基因组中含有6个MAN基因,分布于5条染色体上。没有玉米MAN基因起源于片段复制或串联重复事件。系统发育分析将植物MAN蛋白分为3个亚族(I～Ⅲ),说明其序列已发生分化。玉米MAN基因结构较为保守,蛋白质均含有甘露聚糖酶的核心基序。玉米MAN基因具有不同的表达模式,部分基因在发育叶片中表达量较高,部分基因在减数分裂期雄穗中表达量较高,而其余基因在胚芽鞘、初生根、授粉前果穗、花丝和发育种子中表达量较高。结论]该研究结果为进一步研究玉米MAN基因功能奠定了基础。
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| 关 键 词： | 玉米 甘露聚糖酶 基因家族 进化分析 表达分析 |
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