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猪流行性腹泻病毒河南流行株S基因的克隆与遗传进化分析
作者单位:;1.河南农业大学牧医工程学院;2.河南牧业经济学院;3.郑州市猪重大疫病防控重点实验室
摘    要:近年来,我国大多省市暴发新生仔猪严重流行性腹泻,给养猪业造成巨大经济损失。为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)在河南省的流行和遗传变异情况,本研究对2014—2015年收集的30份临床腹泻样品,进行RT-PCR检测,对检测为阳性的PEDV样品进行S基因的克隆与序列分析。结果表明,30份临床腹泻样品中,RT-PCR检测出22个PEDV阳性样品,克隆的22条PEDV S序列与GenBank中发表的29条PEDVS基因序列核苷酸同源性为93.1%~99.2%。与经典毒株相比,22株河南流行株在S1区域存在碱基的插入、缺失现象;S基因遗传进化树表明,PEDV分为2群,河南流行株均属于PEDVП群,与近年国内分离株和韩国野毒株有较近亲缘关系,而与欧洲株以及中国目前使用的疫苗株亲缘关系较远,基因差异较大。

关 键 词:流行性腹泻病毒  S基因  遗传进化分析

Cloning and phylogenetic analysis of S gene of porcine epidemic diarrhea virus prevailing in Henan province
Abstract:
Keywords:
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