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| 猪流行性腹泻病毒LN-2015-1株分离鉴定及其S基因的变异分析 | |
| 作者单位： | ;1.锦州医科大学畜牧兽医学院;2.中国科学院微生物研究所;3.辽宁省动物卫生监测预警中心;4.营口市动物疫病预防控制中心 |
| 摘 要： | 为了解辽宁猪流行性腹泻病毒(PEDV)来源及变异特性,经PCR诊断,细胞分离,细胞病变观察、RT-PCR以及S基因序列鉴定,成功分离1株PEDV毒株(LN-2015-1)。S基因序列分析显示,与CV777毒株相比,除点突变外,分离株还出现最长9bp的插入,6bp的缺失和13bp连续突变。氨基酸也存在最长3aa插入和2aa缺失,同时存在4处连续3个及以上的氨基酸突变,抗原表位分析表明在5个表位区共发生16个氨基酸的突变。同源性分析显示与HB-HA2015毒株的同源关系最近,序列相似性为99.2%,与2010年以来国内外代表变异毒株同源性较高,达到98.5%~98.8%,而与2010年以前的传统同源性较低,在93.2%~95.6%之间;进化树分析显示该毒株与近年来国内外流行的变异毒株属于同一群,并且与HB-HA2015形成一小的分支,而与传统毒株进化距离较远。 |
| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒 辽宁分离株 S基因 抗原表位 变异分析 |
Isolation and identification of porcine epidemic diarrhea virus strain LN-2015-1 and its S gene mutation analysis |
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