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基于正交设计的畜禽废水处理中活性污泥DNA的16S rDNA-PCR扩增体系
引用本文:谢晴,曹伟,伍阳,邓仕槐,胡小梅,段莎丽,叶红.基于正交设计的畜禽废水处理中活性污泥DNA的16S rDNA-PCR扩增体系[J].农业环境科学学报,2008,27(5).
作者姓名:谢晴  曹伟  伍阳  邓仕槐  胡小梅  段莎丽  叶红
作者单位:1. 四川农业大学资源环境学院环境科学与工程系,四川,雅安,625014
2. 重庆市垫江县环保局,重庆,408300
基金项目:四川农业大学校科研和教改项目,四川省公益性重大项目
摘    要:用SBR反应器处理畜禽废水,提取其中好氧活性污泥总DNA,比较3种物理破壁方法对DNA质量的影响,同时选择4个因素(DNA模板,Mg2 ,dNTP,引物)对16S rDNA-PCR反应体系进行正交优化,并确定最适退火温度.结果表明,反复冻融法的DNA纯度大于玻珠振荡法和摇床振荡法,可不经纯化直接扩增;DNA浓度对PCR结果影响最大,Mg2 和dNTP浓度的影响次之且程度相同,引物浓度影响最小;最佳PCR扩增体系(25 μL)的组成为:模板DNA 0.32 μg,dNTP 200 μmol·L-1,Mg2 1.5 mmol·L-1,引物1.0μmol·L-1,Taq DNA聚合酶0.2U,且最适退火温度为56.5℃.

关 键 词:冻融  PCR扩增  正交设计

The 16S rDNA-PCR Reaction System of DNA from Activated Sludge in Livestock Wastewater Treatment Optimized by Orthogonal Design
XIE Qing,CAO Wei,WU Yang,DENG Shi-huai,HU Xiao-mei,DUAN Sha-li,YE Hong.The 16S rDNA-PCR Reaction System of DNA from Activated Sludge in Livestock Wastewater Treatment Optimized by Orthogonal Design[J].Journal of Agro-Environment Science( J. Agro-Environ. Sci.),2008,27(5).
Authors:XIE Qing  CAO Wei  WU Yang  DENG Shi-huai  HU Xiao-mei  DUAN Sha-li  YE Hong
Abstract:
Keywords:SBR
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