| 棉籽大小与形状关联标记发掘及候选基因筛选 |
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| 引用本文： | 柯会锋,孙正文,王国宁,孟成生,吴立强.棉籽大小与形状关联标记发掘及候选基因筛选[J].中国农业科技导报,2022,24(11):76-86. |
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| 作者姓名： | 柯会锋 孙正文 王国宁 孟成生 吴立强 |
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| 作者单位： | 1.河北农业大学农学院, 华北作物改良与调控国家重点实验室, 河北 保定 071001;2.河北农业大学生命科学学院, 河北 保定 071001 |
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| 基金项目： | 财政部与农业农村部国家棉花产业技术体系建设项目(CARS-15-03);河北农业大学引进人才科研专项(YJ201824) |
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| 摘 要： | 棉籽在油脂、饲料加工等领域具有重要用途，且影响纤维产量和品质。为发掘棉籽性状遗传位点与候选基因，利用419份具有丰富遗传变异的棉花品种资源构成的自然群体，在2个年度鉴定其棉籽性状，结合群体重测序SNP基因型进行全基因组关联分析。结果发现，供试群体棉籽长度、宽度、长宽比、面积与周长等性状存在较大遗传变异，变异系数3.91%~9.55%；有7个SNPs在2年同时被检测到与棉籽大小和形状关联，有23个SNPs在1年与3个以上棉籽相关性状关联，其中D11染色体D11∶50561153在2年与粒宽、面积和周长关联，D12染色体D12：56031535在2年与粒长、面积和周长关联；同时，D05染色体在2年检测到4个与籽粒长宽比显著关联SNPs，A07染色体检测到10个与粒长、周长和面积关联SNPs，且单倍型间相关性状差异极显著。进一步分析发现，关联位点附近存在21个候选基因随棉花胚珠发育进程表达量呈现增加趋势，其中Gh_D05G0148编码乙烯调控反应的EBF蛋白（EIN3-binding F-box protein），该基因在棉花开花后1~35 d的胚珠中优势表达，且以开花后10 d表达量最高；同时，候选基因Gh_D05G0144编码胚珠发育相关YABBY转录因子，该基因在棉花开花后20~35 d的胚珠中表达量较高，推测与棉籽后期发育有关。以上结果为棉籽多性状同步改良提供了选择标记与基因，为实现纤维和棉籽性状同步遗传改良奠定了基础。
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| 关 键 词： | 棉花 棉籽大小 棉籽形状 关联分析 候选基因 |
| 收稿时间： | 2022-04-23 |
Mining and Screening of Associated Markers and Candidate Genes Related to Seed Size and Shape in Cotton |
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| Huifeng KE,Zhengwen SUN,Guoning WANG,Chengsheng MENG,Liqiang WU.Mining and Screening of Associated Markers and Candidate Genes Related to Seed Size and Shape in Cotton[J].Journal of Agricultural Science and Technology,2022,24(11):76-86. |
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| Authors: | Huifeng KE Zhengwen SUN Guoning WANG Chengsheng MENG Liqiang WU |
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| Institution: | 1.State Key Laboratory of North China Crop Improvement and Regulation，College of Agronomy，Hebei Agricultural University，Hebei Baoding 071001，China;2.College of Life Science，Hebei Agricultural University，Hebei Baoding 071001，China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cotton seed size seed shape association analysis candidate genes |
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