| 紫花苜蓿耐苏打盐碱相关基因的转录组学分析 |
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| 引用本文： | 李红,李波,邬婷婷,杨曌,方志坚,焦德志,孙婴宁.紫花苜蓿耐苏打盐碱相关基因的转录组学分析[J].草地学报,2019,27(4):848-858. |
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| 作者姓名： | 李红 李波 邬婷婷 杨曌 方志坚 焦德志 孙婴宁 |
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| 作者单位： | 1. 黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院, 黑龙江 齐齐哈尔 161005;2. 齐齐哈尔大学生命科学与农林学院, 抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室, 黑龙江 齐齐哈尔 161006 |
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| 基金项目： | 齐齐哈尔大学研究生创新科研项目;基本科研业务费项目;基本科研业务费项目;黑龙江省应用技术研究与开发计划重大项目;科技计划 |
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| 摘 要： | 为了揭示紫花苜蓿适应苏打盐碱环境胁迫机制，本试验采用Illumina HiSeq 4000测序技术对紫花苜蓿叶片进行转录组测序并对基因进行功能预测，测序共获得91 853个Unigenes，总碱基数为65 369 474 bp。Unigenes序列长度分布显示，测序质量较好，可信度高，其中，45 540个Unigenes与其它生物的基因有不同程度的同源性，通过GO，COG及KEGG数据库注释，将Unigenes具体定位到次生代谢物的生物合成途径、抗生素合成途径、光合作用途径等。紫花苜蓿叶片苏打盐碱胁迫响应中GH3，MYB，HSF等转录因子均发生不同程度的上调，而EREBP转录因子总体受到抑制，同时候选了4CL，PP2C基因及相关转录因子。从91 853个Unigenes中共检测到10 949个SSR位点，包括6类核苷酸基序，A/T出现频率最高，其次为AG/CT和AAG/CTT。qRT-PCR荧光定量检测5个基因的表达趋势与RNA-Seq分析结果一致，证明RNA-Seq测序的可靠性。本研究通过对紫花苜蓿转录组研究，为优质牧草的分子生物学研究提供数据库来源。
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| 关 键 词： | 紫花苜蓿 苏打盐碱 RNA-Seq测序 功能分类 SSR分析 qRT-PCR验证 |
| 收稿时间： | 2018-12-06 |
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