基于越橘果实转录组测序WBC型转运蛋白基因发掘及表达分析 |
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引用本文: | 康立敏,孙海悦,陈丽,刘红弟,耿金曼,盖钰卓,刘禹姗,王静,汪立宇.基于越橘果实转录组测序WBC型转运蛋白基因发掘及表达分析[J].东北农业大学学报,2015,46(5). |
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作者姓名: | 康立敏 孙海悦 陈丽 刘红弟 耿金曼 盖钰卓 刘禹姗 王静 汪立宇 |
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作者单位: | 吉林农业大学园艺学院,长春,130118 |
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基金项目: | 公益性行业(农业)科研专项,国家自然科学基金项目,高等学校博士学科点专项科研基金,人事部留学人员科技活动择优资助项目 |
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摘 要: | 为发掘越橘中WBC型(White brown complex)ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporters)基因,研究其与次生代谢物质(Secondary metabolite)运输关系,从越橘果实转录组测序文库中筛选出21个编码WBC型转运蛋白基因。其中10个基因上调表达,11个基因下调表达,10个上调表达基因中有7个基因显著上调表达。以越橘‘北陆’(Northland)根、茎、叶芽、叶、花芽、花、绿果、粉果、蓝果、蓝果种子、蓝果果皮和蓝果果肉为试验材料,对7个显著上调表达基因进行实时荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,q RT-PCR)分析,研究在越橘各个器官和果实发育不同阶段中表达模式。结果表明,越橘中7个WBC转运蛋白基因中有5个基因在果皮和果肉中的表达情况与转录组分析结果一致。越橘所有组织器官中均能检测到WBC型转运蛋白表达,但表达量不同。Unigene5067_All和Unigene27766_All在根中表达量最高,Unigene14517_All、Unigene27928_All和Unigene29820_All分别在茎、花和蓝果中表达量最高,Unigene34381_All和Unigene34438_All表达量从绿果、粉果到蓝果呈递增表达模式,与越橘中花色素苷累积呈现一致性,推测这两个WBC转运蛋白基因可能参与越橘次生代谢物运输。有助于阐明越橘中WBC转运蛋白生理生化功能。
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关 键 词: | 越橘 WBC型转运蛋白 荧光定量PCR 表达分析 |
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