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| 谷物胚乳性状QTL区间作图的贝叶斯方法 | |
| 引用本文： | 王亚民,孙长森,汤在祥,胡治球,徐辰武.谷物胚乳性状QTL区间作图的贝叶斯方法[J].扬州大学学报(农业与生命科学版),2008,29(3). |
| 作者姓名： | 王亚民 孙长森 汤在祥 胡治球 徐辰武 |
| 作者单位： | 1. 扬州大学,江苏省作物遗传生理重点实验室,教育部植物功能基因组学重点实验室,江苏,扬州,225009;连云港职业技术学院,基础部,江苏,连云港,222006 2. 台州学院,生命科学学院,浙江,临海,317000 3. 扬州大学,江苏省作物遗传生理重点实验室,教育部植物功能基因组学重点实验室,江苏,扬州,225009 |
| 基金项目： | 国家重大基础研究发展规划，教育部"新世纪优秀人才支持计划"，江苏省自然科学基金 |
| 摘 要： | 将贝叶斯统计原理和胚乳性状的数量遗传模型相结合,以分离群体中各植株的分子标记基因型以及植株上若干粒种子胚乳性状的单粒观测值为数据模式,提出胚乳性状QTL区间作图的贝叶斯方法.该方法通过Gibbs以及Metropolis-Hastings抽样实现的马尔科夫链蒙特卡罗(MCMC)算法获得QTL效应和位置的估计.方法的有效性用染色体水平和基因组水平2套模拟方案进行验证,结果表明:贝叶斯方法能够准确地估计胚乳性状QTL的位置和效应,并同时区分2种显性效应. |
| 关 键 词： | 数量性状基因座位 贝叶斯统计 胚乳性状 MCMC算法 Gibbs抽样 Metropolis-Hastings算法 |
Bayesian method for mapping QTL controlling endosperm traits in cereals |
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| WANG Ya-min,SUN Chang-sen,TANG Zai-xiang,HU Zhi-qiu,XU Chen-wu.Bayesian method for mapping QTL controlling endosperm traits in cereals[J].Journal of Yangzhou University:Agricultural and Life Science Edition,2008,29(3). | |
| Authors: | WANG Ya-min SUN Chang-sen TANG Zai-xiang HU Zhi-qiu XU Chen-wu |
| Institution: | 1.Key Lab of Crop Gen and Phys of Jiangsu Prov;Key Lab of Plant Funct Genomics of MOE;Yangzhou Univ;Yangzhou 225009;China;2.Bas Courses of Lianyungang Tech Coll;Lianyungang 222006;3.Sch of Life Sci;Taizhou Univ;Linhai 317000;China |
| Abstract: | Endosperm traits refer to those characters that determined the grain quality in cereals.The genetic study of endosperm traits plays a fundamental and vital role in improving grain quality.Based on Bayesian statistics and quantitative genetic model of triploid endosperm traits,we proposed a Bayesian method for mapping QTL underlying endosperm traits,which used the DNA molecular marker genotypes of each plant in segregation population and the single endosperm observation of a few endosperms of each plant as d... |
| Keywords: | quantitative trait loci Bayesian statistics endosperm traits MCMC Gibbs sampling Metropolis-Hastings algorithm |
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