| 基于16S rRNA基因克隆文库技术分析广西富钟水牛瘤胃产甲烷菌组成及多样性 |
| |
| 引用本文： | 杨承剑,梁辛,韦升菊,李舒露,梁贤威,邹彩霞,杨炳壮,李丽莉.基于16S rRNA基因克隆文库技术分析广西富钟水牛瘤胃产甲烷菌组成及多样性[J].动物营养学报,2014(12):3635-3642. |
| |
| 作者姓名： | 杨承剑 梁辛 韦升菊 李舒露 梁贤威 邹彩霞 杨炳壮 李丽莉 |
| |
| 作者单位： | 中国农业科学院广西水牛研究所，农业部(广西)水牛遗传繁育重点实验室，南宁 530001 |
| |
| 基金项目： | 广西自然基金青年基金项目，广西水产畜牧兽医局科技计划项目，农业部948项目 |
| |
| 摘 要： | 本研究旨在利用16S rRNA基因克隆库技术分析广西富钟水牛瘤胃产甲烷菌组成及多样性。选取3头体况基本一致的健康雌性富钟水牛作为试验动物,采用机械破壁法提取瘤胃内容物总DNA,采用产甲烷菌引物Met86F/Met1340R扩增16S rRNA基因,构建16S rRNA基因克隆文库。结果表明,本试验共获得93个非嵌合体16S rRNA序列,按照97%的相似性划分为39个分类操作单元（OTU）。其中,60个序列（15个OTU）与已培养细菌16S rRNA序列相似性≥97%,占总序列的64.5%;32个序列（23个OTU）与已培养菌16S rRNA序列相似性处于90%<97%;仅有1个序列与Methanomassiliicoccus luminyensis相似性<90%。系统发育树分析表明,98.9%的序列均属于甲烷杆菌目（Methanobacteriales）,部分序列与Methanobacteriales中任何已知相似序列都相隔较远,它们可能代表Methanobacteriales中新的属或种。由上述结果可见,富钟水牛瘤胃产甲烷菌以Methanobacteriales为优势菌群,其中有许多未知的产甲烷菌需进一步分离培养并对其功能进行分析。
|
| 关 键 词： | 富钟水牛 瘤胃 产甲烷菌 多样性 |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
