| 星豹蛛细胞色素CYP3001U15基因克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 任彦鸿,王雅丽,赵瑞,田国强,燕晶晶,李锐.星豹蛛细胞色素CYP3001U15基因克隆与生物信息学分析[J].山西农业科学,2020,48(6). |
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| 作者姓名： | 任彦鸿 王雅丽 赵瑞 田国强 燕晶晶 李锐 |
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| 作者单位： | 山西农业大学农学院,山西太谷030801;山西农业大学农学院,山西太谷030801;山西农业大学农学院,山西太谷030801;山西农业大学农学院,山西太谷030801;山西农业大学农学院,山西太谷030801;山西农业大学农学院,山西太谷030801 |
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| 基金项目： | 农业农村部农产品质量安全监管专项;山西省高等学校科技研究优秀成果培育项目 |
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| 摘 要： | 星豹蛛是农业害虫的重要捕食性天敌。通过转录组测序鉴定出66条星豹蛛细胞色素P450基因,进一步筛选分析出5条基因,预测其与外源物质代谢有关。为进一步研究星豹蛛细胞色素P450功能和代谢机制,选取其中一条基因进行生物信息学研究。试验通过RT-PCR扩增技术,将星豹蛛总RNA反转录cDNA,后以此为模板进行PCR扩增,回收纯化产物完成单克隆并测序,获取该基因序列信息,并对其进行生物信息学分析。结果发现,克隆到CYP3001U15基因ORF序列,该基因开放阅读框为1 074 bp,编码357个氨基酸,分子质量为42 ku,等电点为5.91,原子总数为5 808,分子式为C_(1877)H_(2896)N_(494)O_(531)S_(10);正电荷残基47个,占氨基酸总数的13.2%,负电荷残基52个,占氨基酸总数的14.6%;蛋白的二级结构预测结果显示,α螺旋占47.62%,β折叠占8.96%,β转角占4.76%,无规则卷曲占38.66%;亚细胞定位预测结果显示,其定位在细胞内质网上;蛋白信号肽预测结果显示,该蛋白不存在信号肽;跨膜结构预测分析结果显示,其不存在跨膜结构。研究结果可就星豹蛛细胞色素P450基因对杀虫剂等外源物代谢的研究提供理论基础。
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| 关 键 词： | 星豹蛛 细胞色素P450 基因克隆 生物信息学分析 |
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