| 谷子OFP基因家族的鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 郭昱,李娜,李珊,韩渊怀,段明,马芳芳.谷子OFP基因家族的鉴定及表达分析[J].山西农业科学,2020,48(4). |
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| 作者姓名： | 郭昱 李娜 李珊 韩渊怀 段明 马芳芳 |
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| 作者单位： | 山西农业大学农学院,山西太谷030801;山西农业大学农学院,山西太谷030801;山西农业大学生物工程研究所,山西太谷030801;山西农业大学生物工程研究所,山西太谷030801 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;山西省重点研发计划项目;山西省重点研发计划项目;山西省青年科技研究基金;山西农业大学校基金项目;山西农业大学校基金项目;山西农业大学校基金项目;山西农业大学科技创新项目 |
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| 摘 要： | 谷子是我国重要的粮饲作物,具有抗旱耐贫瘠的特点,OFP家族是植物特有的一类调节植物生长和发育的转录因子,参与调控植物的抗逆性。为了探索谷子OFP家族基因的特征和功能,通过基因定位、基因结构分析、motif预测、进化分析与顺式作用元件分析及亚细胞定位预测来解析谷子OFP家族基因的特征,分析谷子与拟南芥和水稻基因组中的OFP家族基因的共线性、选择压力,最后分析谷子OFP家族基因的表达模式。结果表明,共筛选到谷子OFP家族基因34个,分布在8条染色体上;进化分析发现,谷子OFP家族基因可以分为3个亚类;motif预测中共鉴定到8个motif基序;顺式作用元件分析发现,与干旱响应相关的OFP基因共22个;与拟南芥的5个基因、水稻的31个基因存在共线性;18个OFP家族基因被预测定位到细胞核内;谷子OFP家族基因在穗中表达量最多,干旱胁迫下的OFP基因大多表现下调,具有时空特异性。OFP家族基因Seita.2G184300、Seita.7G093000、Seita.3G008900的表达差异可能是造成豫谷1号和安-04抗旱性差异较大的原因之一。结果可为谷子OFP家族基因的功能研究提供基础。
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| 关 键 词： | OFP基因家族 谷子 抗旱 表达分析 |
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