甘薯花青素合成酶(ANS)基因的克隆及其组织表达模式分析 |
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引用本文: | 杨慧珍.甘薯花青素合成酶(ANS)基因的克隆及其组织表达模式分析[J].山西农业科学,2020,48(11). |
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作者姓名: | 杨慧珍 |
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作者单位: | 山西农业大学农学院,山西太原030031 |
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摘 要: | 从NCBI数据库中检索得到甘薯ANS序列,利用同源比对在前期转录组数据库中筛选获得同源序列,通过PCR反应克隆出甘薯ANS基因(IbANS)的c DNA全长序列,进而预测和分析IbANS基因的蛋白质序列,同时对其在不同甘薯品种的不同组织进行了实时定量PCR分析。结果表明,该c DNA具有最大开放阅读框(ORF),共1 086个碱基,编码362个氨基酸残基;ANS蛋白为亲水性蛋白质,不存在信号肽;保守结构域预测分析表明,该基因编码的蛋白具有典型的ANS蛋白功能结构域,属于2OG-Fe II_Oxy双加氧酶超家族;系统进化树分析显示,甘薯ANS与三浅裂野牵牛亲缘关系最近;荧光定量PCR结果表明,IbANS在紫心甘薯块根中高表达。研究结果可为进一步阐明IbANS基因在紫心甘薯块根中的形成及累积机制提供理论基础。
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关 键 词: | ANS 甘薯 生物信息学分析 组织表达分析 |
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