| 海岛棉类受体胞质激酶RLCK VI家族全基因组鉴定与胁迫表达分析 |
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| 引用本文： | 赵曾强,朱金成,李洁玉,李志博,李有忠.海岛棉类受体胞质激酶RLCK VI家族全基因组鉴定与胁迫表达分析[J].福建农业学报,2023(6):686-697. |
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| 作者姓名： | 赵曾强 朱金成 李洁玉 李志博 李有忠 |
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| 作者单位： | 1. 新疆农垦科学院棉花研究所/作物种质创新与基因资源利用兵团重点实验室;2. 石河子大学农学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31560074）； |
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| 摘 要： | 【目的】对海岛棉（Gossypium barbadense）类受体胞质激酶RLCK VI(GbRLCK VI)家族基因进行全基因组分析，为深入研究RLCK VI家族基因参与棉花生长发育和抗逆的调控机制提供参考。【方法】基于最新发布的海岛棉基因组数据，利用生物信息学手段对GbRLCK VI家族基因进行全基因组鉴定，并系统分析该家族基因成员的理化性质、序列特征、基因复制、系统进化和表达特征。【结果】海岛棉中共鉴定出39个GbRLCK VI家族基因，经聚类分析将其分为A、B两组，其中A组22个，B组17个，均含有1个激酶结构域，分布于16条染色体，多数位于质膜。基因复制分析表明，该家族在进化过程中发生染色体片段复制事件；Ka/Ks分析显示，所有基因对Ka/Ks均小于1，表明GbRLCK VI家族基因在进化过程中可能经历了严格的纯化选择作用。转录组分析表明，GbRLCK VI家族基因在10个不同组织中的表达模式不同，11个基因在花器官中优势表达，9个基因在根茎叶中优势表达；逆境胁迫下的表达分析显示，8个基因在干旱、盐、黄萎病胁迫下优势表达，4个基因只在黄萎病胁迫下优势表达，说明GbRLCKVI...
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| 关 键 词： | 海岛棉 类受体胞质激酶基因 家族鉴定 生物信息学 表达分析 |
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