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中国新发L1A PRRSV变异株的出现与流行状况分析
引用本文:
许浒,龚帮俊,李超,孙琪,李宛生,赵静,郭镇洋,李金昊,张思钰,相丽润,彭金美,王倩,周国辉,冷超粮,汤艳东,赵鸿远,安同庆,蔡雪辉,张洪亮,田志军.中国新发L1A PRRSV变异株的出现与流行状况分析[J].中国预防兽医学报,2023(8):779-786.
作者姓名:
许浒
龚帮俊
李超
孙琪
李宛生
赵静
郭镇洋
李金昊
张思钰
相丽润
彭金美
王倩
周国辉
冷超粮
汤艳东
赵鸿远
安同庆
蔡雪辉
张洪亮
田志军
作者单位:
1. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所动物疫病防控全国重点实验室;2. 南阳师范学院;3. 安康学院现代农业与生物科技学院
基金项目:
国家自然科学基金(32002315、32172890);;黑龙江省自然科学基金(YQ2022C042);;河南省高等学校重点科研项目(22A230016);
摘 要:
2017年我国首次发现类NADC34 PRRSV,该类病毒属于L1A (Sublineage1.5)亚型。近年来,新发类NADC34 PRRSV在我国不断变异,已经成为危害我国养猪业重要的PRRSV亚型。为了确定新发类NADC34 PRRSV的流行特征,本研究从2021年~2023年37份新发类NADC34 PRRSV阳性病料样品中选择4份样品经PCR分段扩增PRRSV全基因组序列并测序,利用Seq Man软件拼接,获得了4株完整的PRRSV全基因组序列,相应的病毒分别命名为TZJ2165、TZJ2451、TZJ2756、WK621株。下载GenBank中所有中国类NADC34 PRRSV和美国L1C变异株的ORF5基因及NSP2基因序列,利用MEGA7.0构建上述PRRSV ORF5基因序列的遗传进化树,分析其遗传变异情况。利用Megalign软件分析各分支内ORF5基因序列的相似性,以及新发类NADC34 PRRSV NSP2氨基酸序列,分析其是否存在一致的氨基酸缺失特征。根据PRRSV ORF5基因的限制性片段多态性(RFLP)分类方法,对新发类NADC34 PRRSV的ORF5...
关 键 词:
L1A
PRRSV变异株
类NADC30
PRRSV
类NADC34
PRRSV
HP-PRRSV
重组
出现与流行
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