| 胶孢炭疽菌侵染不同抗性葡萄叶片的转录组学分析北大核心CSCD |
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| 引用本文： | 沈才琦孙磊张颖姜建福刘崇怀樊秀彩.胶孢炭疽菌侵染不同抗性葡萄叶片的转录组学分析北大核心CSCD[J].果树学报,2022(5):730-742. |
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| 作者姓名： | 沈才琦孙磊张颖姜建福刘崇怀樊秀彩 |
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| 作者单位： | 1.Zhengzhou Fruit Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Zhengzhou450009; |
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| 基金项目： | 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-29-yc-1)；中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ASTIP-2019-ZFRI)；国家园艺种质资源库运行服务(NHGRC2021-NH00-2)；郑州市重大科技创新专项(2020CXZX0082)。 |
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| 摘 要： | 【目的】通过转录组测序筛选葡萄由胶孢炭疽菌侵染引起的差异表达基因,以进一步分析葡萄抗炭疽病分子机制。【方法】用胶孢炭疽菌侵染不同抗性葡萄的叶片,以清水处理叶片为对照,设置0、24、48、72 h 4个时期取样。采用RNA-seq分析两者间的差异表达基因,挑选出抗病候选基因,并利用qRT-PCR进行验证。【结果】共对42个样品进行转录组测序,每个样品平均数据量为6.65 Gb。KEGG富集分析中差异表达基因主要集中在植物与病原体互作、类黄酮生物合成和MAPK信号途径;转录因子家族分析从MYB、AP2-EREBP、bHLH、NAC和WRKY家族中筛选出12个在抗病株系中高表达的差异表达基因;WGCNA得到抗病相关模块MEdarkgreen。综合各项分析,挑选出9个差异表达基因进行q RT-PCR验证,其中8个基因的表达趋势同转录组测序结果一致。【结论】获得了葡萄响应胶孢炭疽菌侵染的差异表达基因,显著富集在植物与病原体相互作用、类黄酮生物合成和MAPK信号途径等3个通路,并筛选出8个抗病候选基因,包括MLO蛋白,WRKY、ERF转录因子等。
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| 关 键 词： | 葡萄炭疽病 转录组 胶孢炭疽菌 差异表达基因 |
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