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用RT-qPCR方法评价4个不同猪品种骨骼肌候选内参基因
引用本文:陈薪全,潘宇恒,敬云鸿,牛丽莉,甘麦邻,赵叶,陈蕾,沈林園,朱砺.用RT-qPCR方法评价4个不同猪品种骨骼肌候选内参基因[J].四川农业大学学报,2023(6):1107-1115.
作者姓名:陈薪全  潘宇恒  敬云鸿  牛丽莉  甘麦邻  赵叶  陈蕾  沈林園  朱砺
作者单位:1. 四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室;2. 四川农业大学动物科技学院/农业农村部畜禽生物组学重点实验室
基金项目:国家重点研发计划(2021YFD1200801);;四川省科技支撑计划(2021ZDZX0008、2021YFYZ0007、scsztd-2023-08-09);;国家生猪产业技术体系(CARS-pig-35);
摘    要:【目的】寻找合适的规范化策略研究猪骨骼肌相关基因。【方法】筛选TATA结合蛋白(TBP)、次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶(HPRT)、核糖体蛋白L4(RPL4)、肽基脯氨酸异构酶A (PPIA)、β-2微球蛋白(B2M)、酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶活化蛋白(YWHAZ)、β-肌动蛋白(ACTB)和甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH) 8个候选内参基因,选取国外引进的长白、约克与杜洛克公猪,进行三元杂交生产的商品猪(DLY),长白、约克猪进行二元杂交的商品猪(LY),成华猪和藏猪共4个品种进行基因表达正常化评价。采用geNorm、NormFinder和BestKeeper3种常用算法评估候选内参基因的稳定性。将3种常用算法的结果进行综合排名。【结果】8个候选内参基因在不同猪种中表现出较高的表达稳定性,但表达循环阈值不同。【结论】运用3种不同的评估算法可以筛选出相似的候选内参基因,该结果可为猪骨骼肌基因表达RT-qPCR分析内参基因的选择提供参考。

关 键 词:RT-qPCR  候选内参基因  基因表达稳定性  骨骼肌  
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