| 捻转血矛线虫伊维菌素敏感虫株与耐药虫株差异miRNA的转录组学分析 |
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| 引用本文： | 温海峰,张艳敏,张海龙,石雅琴,毛晓伟,寇慧琳,于宇,李峥,陈昕迪,王腾宇,高娃,王文龙,刘春霞.捻转血矛线虫伊维菌素敏感虫株与耐药虫株差异miRNA的转录组学分析[J].中国预防兽医学报,2023(3):245-252. |
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| 作者姓名： | 温海峰 张艳敏 张海龙 石雅琴 毛晓伟 寇慧琳 于宇 李峥 陈昕迪 王腾宇 高娃 王文龙 刘春霞 |
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| 作者单位： | 1. 内蒙古农业大学兽医学院/农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室;3. 河套学院医学系/内蒙古自治区蜱媒人畜共患传染病重点实验室;4. 内蒙古农业大学生命科学学院 |
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| 基金项目： | 内蒙古自然科学基金项目(2020MS03012)； |
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| 摘 要： | 为探究捻转血矛线虫的伊维菌素(IVM)敏感虫株与耐药虫株显著差异的microRNA (miRNA)转录谱，发掘其耐药相关的miRNA，本实验采用Illumina Hiseq2000平台分别对捻转血矛线虫IVM敏感虫株与耐药虫株测序，构建cDNA文库，通过质控后采用生物信息学软件筛选捻转血矛线虫IVM敏感与耐药虫株的差异mi RNA。结果显示，捻转血矛线虫的IVM敏感与耐药虫株筛选出转录显著差异的miRNA共375个，其中253个转录上调，122个转录下调。利用RNAhybrid (V6.01)、Miranda (V3.3a)、TargetScan (V7.0)软件对筛选到的mi RNA靶基因进行预测，并取交集作为mi RNA靶基因预测结果，将筛选出显著差异的靶基因通过perl脚本与显著差异的miRNA进行关联分析，结果显示共关联到2 106对miRNA-mRNA为负调控关系，其中涉及到477个差异的m RNA和603个差异的miRNA。对显著差异的miRNA靶基因进行GO富集分析，结果显示其中有492个GO terms，包括生物过程(BP) 322个、细胞组分(CC) 47个、分子功能...
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| 关 键 词： | 捻转血矛线虫 伊维菌素 耐药性 转录组 mi RNA |
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