猫尾草叶绿体基因组结构及其解析 |
| |
引用本文: | 吴民富,李莎,高柔敏,吴民华,黄琼林.猫尾草叶绿体基因组结构及其解析[J].福建农业学报,2023(9):1094-1102. |
| |
作者姓名: | 吴民富 李莎 高柔敏 吴民华 黄琼林 |
| |
作者单位: | 1. 佛山职业技术学院食品科学系;2. 广东医科大学基础医学院 |
| |
基金项目: | 广东省基础与应用基础研究基金项目(2020A1515110332);;湛江市科技计划项目(2019A01008); |
| |
摘 要: | 【目的】阐明岭南药食两用植物猫尾草的叶绿体基因组结构特征,为猫尾草资源的保护、利用和开发提供理论依据。【方法】采用高通量测序技术开展猫尾草叶绿体基因组测序,并通过生物信息方法进行拼接、注释、解析以及系统进化分析。【结果】猫尾草叶绿体基因组是149 774 bp的环状双链四段式分子,包含128个基因,GC含量为38.2%。猫尾草叶绿体基因组含有26 015个密码子,偏好以A或T结尾;存在110个简单重复序列,以A或T单核苷酸重复居多。序列比对和进化分析显示猫尾草与同属狸尾豆的亲缘关系最近。【结论】首次报道猫尾草叶绿体基因组的全序列,并明确其结构特点,为猫尾草的栽培育种、遗传多样性和资源利用等奠定基础。
|
关 键 词: | 猫尾草 叶绿体基因组 结构分析 序列比对 系统进化关系 |
|
|