棉花β-tubulin基因家族的鉴定及其在纤维发育中的表达 |
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引用本文: | 党媛玥,马建江,杨书贤,宋吉坤,贾冰,冯盼,陈全家,于霁雯.棉花β-tubulin基因家族的鉴定及其在纤维发育中的表达[J].中国农业科学,2023(23):4585-4601. |
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作者姓名: | 党媛玥 马建江 杨书贤 宋吉坤 贾冰 冯盼 陈全家 于霁雯 |
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作者单位: | 1. 新疆农业大学农学院/棉花教育部工程研究中心;2. 中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种及产业技术国家工程研究中心 |
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基金项目: | 国家自然科学基金青年科学基金(32101716);;国家重点研发计划(2022YFD1200300); |
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摘 要: | 【目的】β-微管蛋白是棉纤维细胞形态建成的基本结构单位,在纤维发育过程中具有重要作用。通过鉴定棉花β-tubulin基因家族成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为深入探究β-tubulin基因在棉花纤维发育中的作用提供理论依据。【方法】利用BLAST方法,在4个棉种基因组中鉴定β-tubulin基因家族成员,并结合ProtParam tool分析理化性质、MEGA7.0构建系统进化树、Mapchart2.2绘制染色体定位图、MEME分析保守基序、PlantCARE分析启动子顺式作用元件;根据39个材料发育纤维转录组数据分析陆地棉β-tubulin基因家族的表达水平,并利用Spearman相关性分析鉴定影响纤维品质性状形成的β-tubulin基因。【结果】在陆地棉(Gossypium hirsutum,AD1)、海岛棉(Gossypium barbadense,AD2)、亚洲棉(Gossypium arboretum,A2)和雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii,D5)基因组中分别鉴定到36、37、19和18个β-tubulin基因,且在四倍体棉种中的数目约是二倍体棉种数...
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关 键 词: | 棉花 β-tubulin基因家族 生物信息学 表达分析 纤维发育 |
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