首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

广东省蒲瓜病毒种类鉴定及多重RT-PCR检测方法的建立
引用本文:苏琦,汤亚飞,佘小漫,蓝国兵,于琳,吴正伟,李正刚,何自福.广东省蒲瓜病毒种类鉴定及多重RT-PCR检测方法的建立[J].中国农业科学,2023(23):4684-4695.
作者姓名:苏琦  汤亚飞  佘小漫  蓝国兵  于琳  吴正伟  李正刚  何自福
作者单位:1. 广东海洋大学滨海农业学院;2. 广东省农业科学院植物保护研究所/广东省植物保护新技术重点实验室
基金项目:国家自然科学基金(32272509);;广州市科技计划(202102020504);
摘    要:【目的】探明侵染广东省蒲瓜的病毒种类,建立一种可以同时检测多种蒲瓜病毒的RT-PCR检测方法,提高蒲瓜病毒种类鉴定效率,为蒲瓜病毒病的精准监测与防控提供依据。【方法】2018—2022年间,从广东省广州市、惠州市、清远市、汕头市和湛江市的蒲瓜主要种植区采集蒲瓜病毒病疑似样品78份,对采集的样品按照地区和症状进行分类,提取每份样品的总RNA,将一个地区具有相同症状样品的RNA等量混合后进行小RNA深度测序分析。根据小RNA深度测序分析结果,设计特异引物进行RT-PCR验证,从而明确侵染广东省蒲瓜的病毒种类。挑选6种检出率高、危害严重的蒲瓜病毒,根据GenBank数据库设计多重PCR检测引物,通过优化反应体系和反应条件,建立同时检测6种蒲瓜病毒的多重RT-PCR方法。【结果】从采集的78份蒲瓜疑似病毒病样品中,共检测到12种病毒,按照检出率从高到低分别为葫芦内源RNA病毒(Lagenaria siceraria alphaendornavirus,LSEV)(64.1%)、黄瓜绿斑驳花叶病毒(cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)(62.8%)、...

关 键 词:蒲瓜  病毒病  小RNA深度测序  RT-PCR检测  多重PCR方法
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号