淅川乌骨鸡出壳前后胸肌的全转录组表达谱分析 |
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引用本文: | 石建州,于金冉,王彦伟,王铁军,李娜,刘阳坤,姚伦广.淅川乌骨鸡出壳前后胸肌的全转录组表达谱分析[J].畜牧与饲料科学,2023(5):1-7. |
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作者姓名: | 石建州 于金冉 王彦伟 王铁军 李娜 刘阳坤 姚伦广 |
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作者单位: | 1. 南阳师范学院;3. 郑州大学;4. 南阳农业职业学院;5. 河南省动物疫病防控工程技术研究中心 |
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基金项目: | 河南省科技攻关项目(222102110260);;河南省高等学校重点科研项目(22A180026);;2022年南阳市级科技计划项目(KJGG013,RKX009); |
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摘 要: | 目的]分析淅川乌骨鸡出壳前后胸肌生长过程中全转录组表达谱的变化。方法]采集入孵14 d的淅川乌骨鸡鸡胚胸肌样本(记为X-14 d)和刚出壳1 d的雏鸡胸肌样本(记为X-1 d),围绕编码RNA(messenger RNA,mRNA)、非编码RNA (lncRNA、circRNA和miRNA)进行真核生物全转录组测序分析。结果]淅川乌骨鸡胸肌生长过程中大量基因转录组水平发生显著变化,出孵1 d的雏鸡与入孵14 d的鸡胚相比(X-14 d vs X-1 d),共发现3 858个差异表达mRNA,包括1 054个上调基因和2 804个下调基因;371个差异表达lncRNA,包括222个上调基因和149个下调基因;316个差异表达circRNA,包括148个上调基因和168个下调基因;377个差异表达miRNA,包括159个上调基因和218个下调基因;GO富集分析表明,差异表达mRNA参与多个生物学过程,如生物过程调控、刺激反应、定位、正负调节生物过程、生长过程、免疫系统过程等。对差异表达mRNA进行的KEGG通路富集分析表明,黏附连接、肌动蛋白细胞骨架的调节、氨基酸的生物合成、氧化磷酸...
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关 键 词: | 淅川乌骨鸡 胸肌 全转录组表达谱 基因测序 |
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